RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357179.9

TOP3B-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3B, Length 2,863 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-201ENST00000357179 SNAP91O60641 907 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TGM2P21980 687 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PROZP22891 400 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 NEK2P51955 445 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CDH6P55285 790 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 SP2Q02086 613 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 C6orf183Q5T699 404 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZBTB33Q86T24 672 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TAMM41Q96BW9 452 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TEPSINQ96N21 525 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RNF157Q96PX1 679 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 DRC3Q9H069 523 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PHKG1Q16816 387 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 GPR107Q5VW38 600 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TFAP2CQ92754 450 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PEBP4Q96S96 227 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CNPY3Q9BT09 278 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CSPG5O95196 566 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 JAK1P23458 1154 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PDK2Q15119 407 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ACAD9Q9H845 621 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 SLC22A2O15244 555 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 GPD1P21695 349 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 MAGEA3P43357 314 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 MMRN1Q13201 1228 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PMS2P3Q13401 168 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CYS1Q717R9 158 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ACDQ96AP0 544 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CCDC138Q96M89 665 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 VPS33BQ9H267 617 aa14.93□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TPP1O14773 563 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 KCNN4O15554 427 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PTPN2P17706 415 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 FGFR3P22607 806 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 GSSP48637 474 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZBTB17Q13105 803 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ITGADQ13349 1161 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CAMK2BQ13554 666 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RAB39AQ14964 217 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 OXA1LQ15070 435 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 KCNJ8Q15842 424 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TRIM16LQ309B1 348 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 MTX3Q5HYI7 312 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PLD5Q8N7P1 536 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ASB9Q96DX5 294 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PSD2Q9BQI7 771 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 SCN4AP35499 1836 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 COL4A5P29400 1685 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 RLFQ13129 1914 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PFDN6O15212 129 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 BACE1P56817 501 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TNFAIP1Q13829 316 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 STXBP2Q15833 593 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 INSCQ1MX18 579 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 IER5Q5VY09 327 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZNF786Q8N393 782 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CIB1Q99828 191 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 CTRCQ99895 268 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-201ENST00000357179 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms