RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STX2P32856 288 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPP6Q9NZW5 540 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBK1Q9UHD2 729 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.39■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DFFAO00273 331 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAFKO60675 156 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LILRB3O75022 631 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJB5O95377 273 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AP2A1O95782 977 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPP00450 1065 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LINC00271P0C7V0 271 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRIA1P42261 906 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDST2P52849 883 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMED2Q15363 201 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.39■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DRGXA6NNA5 263 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNG3O60359 315 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP3CCP48454 512 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VEPH1Q14D04 833 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HECTD3Q5T447 861 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD11Q693B1 232 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXL22Q6P050 247 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRABD2AQ86V40 505 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FATE1Q969F0 183 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAFAH2Q99487 392 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL12RB2Q99665 862 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SENP1Q9P0U3 644 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MATN3O15232 486 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGBP02675 491 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1QAP02745 245 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGAP3Q96P47 875 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F5H423 210 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JCHAINP01591 159 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNB1P14635 433 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHN1P15882 459 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKCHP24723 683 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNJLQ8IV13 435 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPP5Q8N3R9 675 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNTD1Q8N815 330 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MDM1Q8TC05 714 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFAP36Q96G28 342 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBP1Q9H171 429 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASA4BC9J798 803 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRRG1O14668 218 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASA4O43374 803 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGF18O76093 207 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMBSP08397 361 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFKB1P19838 968 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELF1P32519 619 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C5orf22Q49AR2 442 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STEAP4Q687X5 459 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYS1Q717R9 158 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FIBCD1Q8N539 461 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAT9Q9BTE0 207 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPN3Q9H201 632 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OBSL1O75147 1896 aa22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBBXA8MT70 800 aa22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEX28O15482 410 aa22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COCHO43405 550 aa22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTSAP10619 480 aa22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJB2P25686 324 aa22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MSH2P43246 934 aa22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms