RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 GPAMQ9HCL2 828 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 CYP2C9P11712 490 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 AOC1P19801 751 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ITGA9Q13797 1035 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 MBLAC2Q68D91 279 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP17Q68EM7 881 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 DNAJB3Q8WWF6 145 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 NCSTNQ92542 709 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 RNF39Q9H2S5 420 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 KPNA7A9QM74 516 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 VILLO15195 856 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ZBTB14O43829 449 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PEX1O43933 1283 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PKNOX1P55347 436 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SNX16P57768 344 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 BST2Q10589 180 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM91A1Q658Y4 838 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 NME8Q8N427 588 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ANKRD52Q8NB46 1076 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 OLFM3Q96PB7 478 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SYT17Q9BSW7 474 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ATXN10Q9UBB4 475 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 H3BNX3 289 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 MAGEB3O15480 346 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 AMHP03971 560 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PCSK6P29122 969 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 WASHC5Q12768 1159 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 NADK2Q4G0N4 442 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 CMC1Q7Z7K0 106 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM42Q8IWZ5 723 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC185Q8N715 623 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 AP4E1Q9UPM8 1137 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 LZTS1Q9Y250 596 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 BRCA2P51587 3418 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PIRO00625 290 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PFDN1O60925 122 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ASLP04424 464 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 CRHR1P34998 444 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 CCR10P46092 362 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ALDH1A3P47895 512 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PDK1Q15118 436 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 MTMR10Q9NXD2 777 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 NRCAMQ92823 1304 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 TFAP2AP05549 437 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SMIM18P0DKX4 95 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PRKCHP24723 683 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PTPN9P43378 593 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 BCAT1P54687 386 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 DPYSL2Q16555 572 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 KLHDC10Q6PID8 442 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC26A9Q7LBE3 791 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 CEP70Q8NHQ1 597 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 MARK4Q96L34 752 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SPAG6O75602 509 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 CLPTM1O96005 669 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM200BP0CF97 657 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 MYBPC3Q14896 1274 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF534Q76KX8 674 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 CRYBG2Q8N1P7 616 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SIGLEC10Q96LC7 697 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SORT1Q99523 831 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 C1orf21Q9H246 121 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPAN17-201ENST00000298564 SNX25Q9H3E2 840 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms