RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627453.2

ABCA9-AS1-202, ABCA9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene ABCA9-AS1, Length 656 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MTMR2Q13614 643 aa10.58□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 BANK1Q8NDB2 785 aa10.58□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 HPS1Q92902 700 aa10.58□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.58□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 LILRB3O75022 631 aa10.57□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 WNT7BP56706 349 aa10.56□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.54□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ALDH1A1P00352 501 aa10.53□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 RFC5P40937 340 aa10.53□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 DESI1Q6ICB0 168 aa10.53□□□□□ -0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.52□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 LINC01559Q495D7 138 aa10.52□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PRR7Q8TB68 274 aa10.52□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 HRCP23327 699 aa10.51□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TREML4Q6UXN2 200 aa10.51□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.51□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PRM3Q9NNZ6 103 aa10.51□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SH3BP2P78314 561 aa10.5□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SIAH2O43255 324 aa10.49□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PTPRNQ16849 979 aa10.49□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.49□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.49□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.49□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 QPCTQ16769 361 aa10.48□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.47□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.47□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 BAP1Q92560 729 aa10.46□□□□□ -0.73
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 BMP1P13497 986 aa10.45□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 KCNH2Q12809 1159 aa10.45□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 C14orf37Q86TY3 774 aa10.45□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PNMA1Q8ND90 353 aa10.45□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TRIM47Q96LD4 638 aa10.45□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CFAP99D6REC4 459 aa10.44□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.44□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 WFS1O76024 890 aa10.43□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MCM6Q14566 821 aa10.43□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.43□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 AP1G2O75843 785 aa10.42□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 LCE2CQ5TA81 110 aa10.42□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZNF511Q8NB15 262 aa10.42□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CTHP32929 405 aa10.41□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 WWC1Q8IX03 1113 aa10.41□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MAP10Q9P2G4 905 aa10.41□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 USP17L8P0C7I0 530 aa10.4□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.4□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SENP2Q9HC62 589 aa10.4□□□□□ -0.74
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 RAD21O60216 631 aa10.39□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 LYPD8Q6UX82 237 aa10.39□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TSC1Q92574 1164 aa10.37□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 FOXJ1Q92949 421 aa10.36□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 A6NJR5 290 aa10.35□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 KIFC2Q96AC6 838 aa10.35□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa10.35□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NNTQ13423 1086 aa10.34□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.34□□□□□ -0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.33□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.32□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZMYND15Q9H091 742 aa10.32□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.31□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZNF592Q92610 1267 aa10.3□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TIMP2P16035 220 aa10.29□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 VEGFBP49765 207 aa10.29□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ARID5BQ14865 1188 aa10.29□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.29□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZFP42Q96MM3 310 aa10.29□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SNRKQ9NRH2 765 aa10.29□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.29□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 WIPF1O43516 503 aa10.28□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ADH1CP00326 375 aa10.27□□□□□ -0.77
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 AGERQ15109 404 aa10.27□□□□□ -0.77
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MPNDQ8N594 471 aa10.27□□□□□ -0.77
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NR3C2P08235 984 aa10.26□□□□□ -0.77
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 WASHC4Q2M389 1173 aa10.26□□□□□ -0.77
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NBPF14Q5TI25 921 aa10.26□□□□□ -0.77
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.26□□□□□ -0.77
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SOBPA7XYQ1 873 aa10.25□□□□□ -0.77
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms