RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC102AQ96A19 550 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 PPM1EQ8WY54 764 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 PANK3Q9H999 370 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 ANAPC15P60006 121 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 NFKBIBQ15653 356 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA1328Q86T90 577 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 UQCRHP07919 91 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 DACH1Q9UI36 760 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 PDCP20941 246 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 RIPK4P57078 832 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 PSME1Q06323 249 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRJ-207ENST00000613246 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 FIBPO43427 364 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF3BO15066 747 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 STK38Q15208 465 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 TNMDQ9H2S6 317 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 MBD3O95983 291 aa22■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 GRIPAP1Q4V328 841 aa22■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC192P0DO97 292 aa22■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 FSD1Q9BTV5 496 aa22■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 EVC2Q86UK5 1308 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 JMYQ8N9B5 988 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 ME1P48163 572 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 MPNDQ8N594 471 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 GOPCQ9HD26 462 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATA24Q86W54 205 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 UBE4AQ14139 1066 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 GPATCH11Q8N954 259 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 SHTN1A0MZ66 631 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 CBFA2T2O43439 604 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 CDC45O75419 566 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.94■■□□□ 1.1
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PTPRJ-207ENST00000613246 DDX11Q96FC9 970 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 APAF1O14727 1248 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 STK3Q13188 491 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 NEK4P51957 841 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM177BA6PVY3 158 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 HIP1O00291 1037 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC69A6NI79 296 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMD1Q99460 953 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 TAF4BQ92750 862 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 MCM2P49736 904 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 UACAQ9BZF9 1416 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 POTEJP0CG39 1038 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 FEZ1Q99689 392 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRJ-207ENST00000613246 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.098e-7■■■■□ 23
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PTPRJ-207ENST00000613246 HMOX1P09601 288 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 CETN2P41208 172 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP9Q49MG5 647 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 CASQ1P31415 396 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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