RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 PDCP20941 246 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 CCDC66A2RUB6 948 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 FYB1O15117 783 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 SMARCE1Q969G3 411 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 KDM4AO75164 1064 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.29□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 MSH5O43196 834 aa14.29□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 BACH2Q9BYV9 841 aa14.29□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.29□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 SPC24Q8NBT2 197 aa14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 OFD1O75665 1012 aa14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 DCTN1Q14203 1278 aa14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 FIBPO43427 364 aa14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 ODF2Q5BJF6 829 aa14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.28□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.27□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 GNAI2P04899 355 aa14.27□□□□□ -0.12
TNS1-220ENST00000611415 BCAR3O75815 825 aa14.27□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.27□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 IL27Q8NEV9 243 aa14.27□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 MYO6Q9UM54 1294 aa14.27□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.27□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.27□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 H0YHG0 523 aa14.26□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 PRKAR2BP31323 418 aa14.26□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.26□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.26□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 CCDC192P0DO97 292 aa14.26□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.25□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.25□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 STK38Q15208 465 aa14.25□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.24□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.24□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.24□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.24□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 TOPBP1Q92547 1522 aa14.24□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 TNMDQ9H2S6 317 aa14.24□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 ANKRD1Q15327 319 aa14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 FBXO3Q9UK99 471 aa14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 TXLNAP40222 546 aa14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.23□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 SERPINC1P01008 464 aa14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 WDR63Q8IWG1 891 aa14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 MTMR7Q9Y216 660 aa14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.22□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 ATP2B1P20020 1258 aa14.21□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.21□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.21□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.21□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.21□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 UQCRHP07919 91 aa14.21□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.21□□□□□ -0.13
TNS1-220ENST00000611415 HECW1Q76N89 1606 aa14.21□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 DACH1Q9UI36 760 aa14.21□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 NLRP6P59044 892 aa14.21□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 STK3Q13188 491 aa14.21□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 JMYQ8N9B5 988 aa14.21□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.2□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 SLC4A2P04920 1241 aa14.2□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.2□□□□□ -0.14
TNS1-220ENST00000611415 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.2□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 236
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms