RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599722.1

MED25-208, Transcript of mediator complex subunit 25, human

TSL 3

Gene MED25, Length 504 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED25-208	ENST00000599722	CABP1	Q9NZU7	370 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MED25-208	ENST00000599722	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MED25-208	ENST00000599722	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MED25-208	ENST00000599722	PANK3	Q9H999	370 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MED25-208	ENST00000599722	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MED25-208	ENST00000599722	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MED25-208	ENST00000599722	AKAP12	Q02952	1782 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MED25-208	ENST00000599722	ADAMTS2	O95450	1211 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	PLEKHG5	O94827	1062 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	ACE	P12821	1306 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	C8orf37	Q96NL8	207 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722		A0A1W2PP64	1363 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MED25-208	ENST00000599722	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	NGLY1	Q96IV0	654 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	AFF2	P51816	1311 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
MED25-208	ENST00000599722	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.7	■■■□□ 2.18
MED25-208	ENST00000599722	ABCA3	Q99758	1704 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MED25-208	ENST00000599722	POTEA	Q6S8J7	498 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MED25-208	ENST00000599722	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MED25-208	ENST00000599722	USP6	P35125	1406 aa		28.68	■■■□□ 2.18
MED25-208	ENST00000599722	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MED25-208	ENST00000599722	SSH2	Q76I76	1423 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MED25-208	ENST00000599722	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
MED25-208	ENST00000599722	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		28.64	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	NSD2	O96028	1365 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	ABTB2	Q8N961	1025 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	USP21	Q9UK80	565 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	ANP32C	O43423	234 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MED25-208	ENST00000599722	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	FYB1	O15117	783 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	RXRB	P28702	533 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	RALBP1	Q15311	655 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	NLRP13	Q86W25	1043 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	USP54	Q70EL1	1684 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	28.52	■■■□□ 2.16
MED25-208	ENST00000599722	NLRP6	P59044	892 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	SLIT2	O94813	1529 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	PIK3C2A	O00443	1686 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	SOCS7	O14512	581 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	FAM83G	A6ND36	823 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	ATRN	O75882	1429 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	NME9	Q86XW9	330 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	USP19	O94966	1318 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	KIAA0232	Q92628	1395 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MED25-208	ENST00000599722	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		28.45	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	COG3	Q96JB2	828 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	BTG4	Q9NY30	223 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	GC	P02774	474 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	MIER1	Q8N108	512 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	CHRNA2	Q15822	529 aa		28.41	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
MED25-208	ENST00000599722	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		28.4	■■■□□ 2.14

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