RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 DEPDC5O75140 1603 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.52□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.52□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
CS-212ENST00000548567 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 ABCC11Q96J66 1382 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 KCNQ2O43526 872 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 UNC13BO14795 1591 aa10.51□□□□□ -0.73
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CS-212ENST00000548567 AMPHP49418 695 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 NLRP13Q86W25 1043 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 PHLPP1O60346 1717 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 EVC2Q86UK5 1308 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 PIK3C2GO75747 1445 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 ZNF428Q96B54 188 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 ARXQ96QS3 562 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 PIK3R4Q99570 1358 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-212ENST00000548567 KIF1BO60333 1816 aa10.47□□□□□ -0.73
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CS-212ENST00000548567 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
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CS-212ENST00000548567 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 DDB1Q16531 1140 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 RGS12O14924 1447 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
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CS-212ENST00000548567 MSL1Q68DK7 614 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 COG3Q96JB2 828 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
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CS-212ENST00000548567 BAG6P46379 1132 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 TCP11L2Q8N4U5 519 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-212ENST00000548567 ANKRD24Q8TF21 1146 aa10.4□□□□□ -0.74
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CS-212ENST00000548567 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 VPS72Q15906 364 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 DIP2AQ14689 1571 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 USP47Q96K76 1375 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 PTCH1Q13635 1447 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
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CS-212ENST00000548567 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 ARHGEF10O15013 1369 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 FYB1O15117 783 aa10.35□□□□□ -0.75
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CS-212ENST00000548567 NBPF4Q96M43 638 aa10.35□□□□□ -0.75
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CS-212ENST00000548567 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-212ENST00000548567 NEUROD2Q15784 382 aa10.34□□□□□ -0.75
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CS-212ENST00000548567 ARHGEF25Q86VW2 580 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-212ENST00000548567 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PP64 1363 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-212ENST00000548567 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-212ENST00000548567 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-212ENST00000548567 PXDNQ92626 1479 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-212ENST00000548567 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-212ENST00000548567 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-212ENST00000548567 MORC1Q86VD1 984 aa10.32□□□□□ -0.76
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