RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 CABP2Q9NPB3 220 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 ACEP12821 1306 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 NRAPQ86VF7 1730 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM83GA6ND36 823 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
SH3BP2-211ENST00000506932 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-211ENST00000506932 TONSLQ96HA7 1378 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-211ENST00000506932 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-211ENST00000506932 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-211ENST00000506932 EP400Q96L91 3159 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-211ENST00000506932 VPS72Q15906 364 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-211ENST00000506932 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-211ENST00000506932 BTG4Q9NY30 223 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-211ENST00000506932 CABP1Q9NZU7 370 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 EVC2Q86UK5 1308 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 KIAA0232Q92628 1395 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 USP6P35125 1406 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 CHRNA2Q15822 529 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 ABTB2Q8N961 1025 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 AKAP12Q02952 1782 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 PIK3C2AO00443 1686 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-211ENST00000506932 USP19O94966 1318 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SSH2Q76I76 1423 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-211ENST00000506932 SLIT3O75094 1523 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 A0A0G2JS52 829 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 MYT1Q01538 1121 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 NLRP13Q86W25 1043 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 STRN4Q9NRL3 753 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 CPDO75976 1380 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 GCP02774 474 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 NLRP6P59044 892 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-211ENST00000506932 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 USP35Q9P2H5 1018 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 COL18A1P39060 1754 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM182BQ5T319 152 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 TESK2Q96S53 571 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 TMC1Q8TDI8 760 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 SOX12O15370 315 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 EVA1CP58658 441 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC125Q86Z20 511 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 NFAT5O94916 1531 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 USP54Q70EL1 1684 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-211ENST00000506932 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 RGPD5Q99666 1765 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 A0A1W2PP64 1363 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 USP47Q96K76 1375 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 NME9Q86XW9 330 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 CRB1P82279 1406 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 BARGINQ6ZT62 677 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-211ENST00000506932 USP31Q70CQ4 1352 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.08■■□□□ 1.12
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