RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498701.1

E2F6-210, Transcript of E2F transcription factor 6, humanhuman

TSL 4

Gene E2F6, Length 610 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6-210ENST00000498701 ABCA3Q99758 1704 aa30.17■■■□□ 2.42
E2F6-210ENST00000498701 FAM83GA6ND36 823 aa30.17■■■□□ 2.42
E2F6-210ENST00000498701 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
E2F6-210ENST00000498701 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.15■■■□□ 2.42
E2F6-210ENST00000498701 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
E2F6-210ENST00000498701 TONSLQ96HA7 1378 aa30.14■■■□□ 2.41
E2F6-210ENST00000498701 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.13■■■□□ 2.41
E2F6-210ENST00000498701 EVC2Q86UK5 1308 aa30.1■■■□□ 2.41
E2F6-210ENST00000498701 VPS72Q15906 364 aa30.09■■■□□ 2.41
E2F6-210ENST00000498701 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.09■■■□□ 2.41
E2F6-210ENST00000498701 CABP1Q9NZU7 370 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F6-210ENST00000498701 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.08■■■□□ 2.41
E2F6-210ENST00000498701 GLI3P10071 1580 aa30.07■■■□□ 2.4
E2F6-210ENST00000498701 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.06■■■□□ 2.4
E2F6-210ENST00000498701 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.05■■■□□ 2.4
E2F6-210ENST00000498701 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.04■■■□□ 2.4
E2F6-210ENST00000498701 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.03■■■□□ 2.4
E2F6-210ENST00000498701 BTG4Q9NY30 223 aa30.03■■■□□ 2.4
E2F6-210ENST00000498701 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
E2F6-210ENST00000498701 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
E2F6-210ENST00000498701 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.02■■■□□ 2.4
E2F6-210ENST00000498701 ABTB2Q8N961 1025 aa30.01■■■□□ 2.39
E2F6-210ENST00000498701 ATAD2Q6PL18 1390 aa30■■■□□ 2.39
E2F6-210ENST00000498701 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
E2F6-210ENST00000498701 SSH2Q76I76 1423 aa29.99■■■□□ 2.39
E2F6-210ENST00000498701 USP19O94966 1318 aa29.98■■■□□ 2.39
E2F6-210ENST00000498701 USP6P35125 1406 aa29.98■■■□□ 2.39
E2F6-210ENST00000498701 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.98■■■□□ 2.39
E2F6-210ENST00000498701 KIAA0232Q92628 1395 aa29.98■■■□□ 2.39
E2F6-210ENST00000498701 NRAPQ86VF7 1730 aa29.96■■■□□ 2.39
E2F6-210ENST00000498701 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 NLRP13Q86W25 1043 aa29.94■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.94■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 CHRNA2Q15822 529 aa29.92■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 EP400Q96L91 3159 aa29.92■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 GCP02774 474 aa29.91■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 CPDO75976 1380 aa29.9■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.9■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.9■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.89■■■□□ 2.38
E2F6-210ENST00000498701 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.87■■■□□ 2.37
E2F6-210ENST00000498701 NLRP6P59044 892 aa29.86■■■□□ 2.37
E2F6-210ENST00000498701 TESK2Q96S53 571 aa29.86■■■□□ 2.37
E2F6-210ENST00000498701 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
E2F6-210ENST00000498701 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
E2F6-210ENST00000498701 CCDC125Q86Z20 511 aa29.84■■■□□ 2.37
E2F6-210ENST00000498701 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.84■■■□□ 2.37
E2F6-210ENST00000498701 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.83■■■□□ 2.37
E2F6-210ENST00000498701 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.82■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.82■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.82■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.82■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 SLIT3O75094 1523 aa29.81■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.81■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.81■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.8■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.8■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 AKAP12Q02952 1782 aa29.8■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 PIK3C2AO00443 1686 aa29.8■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 STRN4Q9NRL3 753 aa29.8■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.79■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.78■■■□□ 2.36
E2F6-210ENST00000498701 EVA1CP58658 441 aa29.76■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 TMC1Q8TDI8 760 aa29.75■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.75■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 SLC24A1O60721 1099 aa29.74■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 A0A0G2JS52 829 aa29.73■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 MYT1Q01538 1121 aa29.73■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.72■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 BARGINQ6ZT62 677 aa29.72■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.72■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.71■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 USP31Q70CQ4 1352 aa29.71■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.71■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
E2F6-210ENST00000498701 USP47Q96K76 1375 aa29.69■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.68■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 USP35Q9P2H5 1018 aa29.68■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.68■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.68■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 A0A1W2PP64 1363 aa29.67■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.67■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 COL18A1P39060 1754 aa29.66■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.65■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.65■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 NME9Q86XW9 330 aa29.65■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 NFAT5O94916 1531 aa29.64■■■□□ 2.34
E2F6-210ENST00000498701 FAM182BQ5T319 152 aa29.63■■■□□ 2.33
E2F6-210ENST00000498701 CRB1P82279 1406 aa29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms