RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498701.1

E2F6-210, Transcript of E2F transcription factor 6, humanhuman

TSL 4

Gene E2F6, Length 610 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6-210ENST00000498701 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.12■■■■■ 5.93
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E2F6-210ENST00000498701 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.97■■■■■ 4.63
E2F6-210ENST00000498701 NACADO15069 1562 aa43.84■■■■■ 4.61
E2F6-210ENST00000498701 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.71■■■■■ 4.59
E2F6-210ENST00000498701 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.48■■■■■ 4.55
E2F6-210ENST00000498701 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
E2F6-210ENST00000498701 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.12■■■■■ 4.49
E2F6-210ENST00000498701 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.94■■■■■ 4.46
E2F6-210ENST00000498701 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.91■■■■■ 4.46
E2F6-210ENST00000498701 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.78■■■■■ 4.44
E2F6-210ENST00000498701 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.73■■■■■ 4.43
E2F6-210ENST00000498701 SCRIBQ14160 1630 aa42.34■■■■■ 4.37
E2F6-210ENST00000498701 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.21■■■■■ 4.35
E2F6-210ENST00000498701 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
E2F6-210ENST00000498701 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.55■■■■■ 4.24
E2F6-210ENST00000498701 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.37■■■■■ 4.21
E2F6-210ENST00000498701 NCAPD3P42695 1498 aa40.54■■■■■ 4.08
E2F6-210ENST00000498701 SMARCA4P51532 1647 aa40.49■■■■■ 4.07
E2F6-210ENST00000498701 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.47■■■■■ 4.07
E2F6-210ENST00000498701 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
E2F6-210ENST00000498701 SMARCA2P51531 1590 aa40.32■■■■■ 4.05
E2F6-210ENST00000498701 HMGXB3Q12766 1538 aa40.21■■■■■ 4.03
E2F6-210ENST00000498701 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.16■■■■■ 4.02
E2F6-210ENST00000498701 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.15■■■■■ 4.02
E2F6-210ENST00000498701 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
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E2F6-210ENST00000498701 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.45■■■■□ 3.91
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E2F6-210ENST00000498701 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
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E2F6-210ENST00000498701 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.07■■■■□ 3.85
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E2F6-210ENST00000498701 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.87■■■■□ 3.81
E2F6-210ENST00000498701 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.85■■■■□ 3.81
E2F6-210ENST00000498701 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.82■■■■□ 3.81
E2F6-210ENST00000498701 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.81■■■■□ 3.8
E2F6-210ENST00000498701 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.78■■■■□ 3.8
E2F6-210ENST00000498701 WDR62O43379 1518 aa38.74■■■■□ 3.79
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E2F6-210ENST00000498701 TOPBP1Q92547 1522 aa38.15■■■■□ 3.7
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E2F6-210ENST00000498701 ABCC8Q09428 1581 aa38.1■■■■□ 3.69
E2F6-210ENST00000498701 IFT140Q96RY7 1462 aa38.03■■■■□ 3.68
E2F6-210ENST00000498701 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.02■■■■□ 3.68
E2F6-210ENST00000498701 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.92■■■■□ 3.66
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E2F6-210ENST00000498701 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.62■■■■□ 3.61
E2F6-210ENST00000498701 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.59
E2F6-210ENST00000498701 WDR97A6NE52 1622 aa37.39■■■■□ 3.58
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E2F6-210ENST00000498701 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.27■■■■□ 3.56
E2F6-210ENST00000498701 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.26■■■■□ 3.55
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E2F6-210ENST00000498701 CHD1O14646 1710 aa37.22■■■■□ 3.55
E2F6-210ENST00000498701 TOP2BQ02880 1626 aa37.21■■■■□ 3.55
E2F6-210ENST00000498701 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.19■■■■□ 3.54
E2F6-210ENST00000498701 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.18■■■■□ 3.54
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E2F6-210ENST00000498701 KIF27Q86VH2 1401 aa36.52■■■■□ 3.44
E2F6-210ENST00000498701 SHROOM2Q13796 1616 aa36.38■■■■□ 3.41
E2F6-210ENST00000498701 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.38■■■■□ 3.41
E2F6-210ENST00000498701 JPH4Q96JJ6 628 aa36.3■■■■□ 3.4
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E2F6-210ENST00000498701 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.24■■■■□ 3.39
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