RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 SOBPA7XYQ1 873 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 VSIG8P0DPA2 414 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 BARGINQ6ZT62 677 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 MPNDQ8N594 471 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 ZNF511Q8NB15 262 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 ZMYND10O75800 440 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 TIMP2P16035 220 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 KCNH2Q12809 1159 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 BAP1Q92560 729 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 MAN1A2O60476 641 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 GDF11O95390 407 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 RASSF7Q02833 373 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 DESI1Q6ICB0 168 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 MTMR2Q13614 643 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 AMHR2Q16671 573 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 PRR7Q8TB68 274 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-242ENST00000498280 UPP2O95045 317 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 TRIM66O15016 1216 aa6.62□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 CTHP32929 405 aa6.62□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 ARID5BQ14865 1188 aa6.62□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.62□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 CFAP99D6REC4 459 aa6.61□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 NR5A1Q13285 461 aa6.61□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 CDK15Q96Q40 435 aa6.61□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 PPFIA3O75145 1194 aa6.6□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 BMP2P12643 396 aa6.6□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.6□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.6□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 ITPKCQ96DU7 683 aa6.6□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 HRCP23327 699 aa6.59□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 KRT76Q01546 638 aa6.59□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 AGERQ15109 404 aa6.59□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.59□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 MEIOBQ8N635 442 aa6.59□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.59□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.59□□□□□ -1.35
RBM39-242ENST00000498280 SPTLC1O15269 473 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 GJA5P36382 358 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 LYPD8Q6UX82 237 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 MAP10Q9P2G4 905 aa6.58□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 NR3C2P08235 984 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 FOXJ1Q92949 421 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.57□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 QPCTQ16769 361 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 XP32Q5T750 250 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 FSHRP23945 695 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 IRS1P35568 1242 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 AK7Q96M32 723 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 NBPF14Q5TI25 921 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 SVOPQ8N4V2 548 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RBM39-242ENST00000498280 TTLL8A6PVC2 850 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 GRM5P41594 1212 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 PDE4DQ08499 809 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-242ENST00000498280 WHAMMQ8TF30 809 aa6.51□□□□□ -1.37
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