RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491163.1

C7orf50-208, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C7orf50, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-208ENST00000491163 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
C7orf50-208ENST00000491163 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.29■■■□□ 2.12
C7orf50-208ENST00000491163 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.28■■■□□ 2.12
C7orf50-208ENST00000491163 TESK2Q96S53 571 aa28.27■■■□□ 2.12
C7orf50-208ENST00000491163 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.25■■■□□ 2.11
C7orf50-208ENST00000491163 USP6P35125 1406 aa28.24■■■□□ 2.11
C7orf50-208ENST00000491163 USP21Q9UK80 565 aa28.23■■■□□ 2.11
C7orf50-208ENST00000491163 AKAP12Q02952 1782 aa28.23■■■□□ 2.11
C7orf50-208ENST00000491163 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
C7orf50-208ENST00000491163 SOCS7O14512 581 aa28.22■■■□□ 2.11
C7orf50-208ENST00000491163 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
C7orf50-208ENST00000491163 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.21■■■□□ 2.11
C7orf50-208ENST00000491163 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.2■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 ABTB2Q8N961 1025 aa28.19■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 SLIT2O94813 1529 aa28.18■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 TMC1Q8TDI8 760 aa28.17■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.16■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.16■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 RXRBP28702 533 aa28.16■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 SSH2Q76I76 1423 aa28.16■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 PIK3C2AO00443 1686 aa28.16■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 ATRNO75882 1429 aa28.15■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.15■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.14■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
C7orf50-208ENST00000491163 FAM83GA6ND36 823 aa28.13■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 RGS12O14924 1447 aa28.1■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.1■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.1■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 USP19O94966 1318 aa28.1■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.1■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 KIAA0232Q92628 1395 aa28.1■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 NRAPQ86VF7 1730 aa28.09■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 TMF1P82094 1093 aa28.08■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.08■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 A0A1W2PP64 1363 aa28.08■■■□□ 2.09
C7orf50-208ENST00000491163 NLRP6P59044 892 aa28.07■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 CHRNA2Q15822 529 aa28.07■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 NLRP13Q86W25 1043 aa28.06■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 BTG4Q9NY30 223 aa28.06■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.083e-6■□□□□ 10.1
C7orf50-208ENST00000491163 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 GLI3P10071 1580 aa28.04■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 SLIT3O75094 1523 aa28.03■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.02■■■□□ 2.08
C7orf50-208ENST00000491163 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.01■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 SLC24A1O60721 1099 aa28.01■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 GCP02774 474 aa28.01■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 NME9Q86XW9 330 aa28■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 MYOM1P52179 1685 aa28■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.99■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.99■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 SOX12O15370 315 aa27.99■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.071e-6■■■■■ 38.9
C7orf50-208ENST00000491163 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 VPS72Q15906 364 aa27.98■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 CPDO75976 1380 aa27.97■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.96■■■□□ 2.07
C7orf50-208ENST00000491163 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.94■■■□□ 2.06
C7orf50-208ENST00000491163 STRN4Q9NRL3 753 aa27.94■■■□□ 2.06
C7orf50-208ENST00000491163 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.94■■■□□ 2.06
C7orf50-208ENST00000491163 CDCA8Q53HL2 280 aa27.93■■■□□ 2.06
C7orf50-208ENST00000491163 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.93■■■□□ 2.06
C7orf50-208ENST00000491163 USP54Q70EL1 1684 aa27.93■■■□□ 2.06
C7orf50-208ENST00000491163 NFAT5O94916 1531 aa27.92■■■□□ 2.06
C7orf50-208ENST00000491163 USP31Q70CQ4 1352 aa27.9■■■□□ 2.06
C7orf50-208ENST00000491163 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.88■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.88■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 COL18A1P39060 1754 aa27.88■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 EP400Q96L91 3159 aa27.87■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.87■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.87■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.87■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.85■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 RGPD5Q99666 1765 aa27.84■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 EVA1CP58658 441 aa27.84■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.84■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.84■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 A0A0G2JS52 829 aa27.83■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 MYT1Q01538 1121 aa27.83■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.83■■■□□ 2.05
C7orf50-208ENST00000491163 USP35Q9P2H5 1018 aa27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms