RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
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PRKCI-202ENST00000476635 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PRKCI-202ENST00000476635 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PRKCI-202ENST00000476635 COL18A1P39060 1754 aa8.76□□□□□ -1.01
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PRKCI-202ENST00000476635 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.74□□□□□ -1.01
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PRKCI-202ENST00000476635 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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PRKCI-202ENST00000476635 RGPD5Q99666 1765 aa8.63□□□□□ -1.03
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PRKCI-202ENST00000476635 IL13P35225 146 aa8.62□□□□□ -1.03
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PRKCI-202ENST00000476635 FLT4P35916 1363 aa8.62□□□□□ -1.03
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PRKCI-202ENST00000476635 NRAPQ86VF7 1730 aa8.62□□□□□ -1.03
PRKCI-202ENST00000476635 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.62□□□□□ -1.03
PRKCI-202ENST00000476635 MTHFSP49914 203 aa8.61□□□□□ -1.03
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PRKCI-202ENST00000476635 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.61□□□□□ -1.03
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PRKCI-202ENST00000476635 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.61□□□□□ -1.03
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PRKCI-202ENST00000476635 NME9Q86XW9 330 aa8.6□□□□□ -1.03
PRKCI-202ENST00000476635 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.6□□□□□ -1.03
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PRKCI-202ENST00000476635 MRC1P22897 1456 aa8.59□□□□□ -1.03
PRKCI-202ENST00000476635 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PRKCI-202ENST00000476635 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.59□□□□□ -1.03
PRKCI-202ENST00000476635 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.59□□□□□ -1.03
PRKCI-202ENST00000476635 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.59□□□□□ -1.03
PRKCI-202ENST00000476635 CACNA1FO60840 1977 aa8.58□□□□□ -1.04
PRKCI-202ENST00000476635 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
PRKCI-202ENST00000476635 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.58□□□□□ -1.04
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