RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCA3Q99758 1704 aa35.25■■■■□ 3.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOCS7O14512 581 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP6P35125 1406 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP21Q9UK80 565 aa35.21■■■■□ 3.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SSH2Q76I76 1423 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.18■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABTB2Q8N961 1025 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLIT2O94813 1529 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RXRBP28702 533 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM83GA6ND36 823 aa35.14■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC24A1O60721 1099 aa35.12■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMC1Q8TDI8 760 aa35.12■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATRNO75882 1429 aa35.11■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AKAP12Q02952 1782 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP19O94966 1318 aa35.08■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.08■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMF1P82094 1093 aa35.08■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.08■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLRP13Q86W25 1043 aa35.05■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.04■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIK3C2AO00443 1686 aa35.03■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.03■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA0232Q92628 1395 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLRP6P59044 892 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.01■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.01■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1W2PP64 1363 aa35■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRDM11Q9NQV5 511 aa35■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NINLQ9Y2I6 1382 aa35■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GCP02774 474 aa34.99■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BTG4Q9NY30 223 aa34.99■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGS12O14924 1447 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHRNA2Q15822 529 aa34.97■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.96■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.96■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLIT3O75094 1523 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VPS72Q15906 364 aa34.95■■■■□ 3.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPDO75976 1380 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRAPQ86VF7 1730 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDCA8Q53HL2 280 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLI3P10071 1580 aa34.91■■■■□ 3.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NME9Q86XW9 330 aa34.91■■■■□ 3.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP31Q70CQ4 1352 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOX12O15370 315 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYOM1P52179 1685 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP54Q70EL1 1684 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NFAT5O94916 1531 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.8■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.79■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.79■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STRN4Q9NRL3 753 aa34.79■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.77■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.77■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL18A1P39060 1754 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EVA1CP58658 441 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FYB1O15117 783 aa34.69■■■■□ 3.14
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