RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 ERBINQ96RT1 1412 aa15.59■□□□□ 0.09
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PTPRK-207ENST00000368226 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
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PTPRK-207ENST00000368226 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRK-207ENST00000368226 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-207ENST00000368226 FIBPO43427 364 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-207ENST00000368226 OLFM4Q6UX06 510 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-207ENST00000368226 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-207ENST00000368226 SRGAP3O43295 1099 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-207ENST00000368226 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-207ENST00000368226 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
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