RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 RUNDC1Q96C34 613 aa28.33■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 SLFN5Q08AF3 891 aa28.33■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SNRNP25-201ENST00000293861 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
SNRNP25-201ENST00000293861 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.3■■■□□ 2.12
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.29■■■□□ 2.12
SNRNP25-201ENST00000293861 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.28■■■□□ 2.12
SNRNP25-201ENST00000293861 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.27■■■□□ 2.12
SNRNP25-201ENST00000293861 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
SNRNP25-201ENST00000293861 E9PSI1 815 aa28.25■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.25■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNA6P17658 529 aa28.24■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.23■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 WWC1Q8IX03 1113 aa28.23■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.23■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC27Q2M243 656 aa28.22■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.21■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 NME9Q86XW9 330 aa28.21■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 ACEP12821 1306 aa28.21■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.21■■■□□ 2.11
SNRNP25-201ENST00000293861 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 USP6P35125 1406 aa28.19■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 COG3Q96JB2 828 aa28.19■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 POLKQ9UBT6 870 aa28.18■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.17■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.16■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR63Q8IWG1 891 aa28.16■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.15■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.15■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 NUTM2FA1L443 756 aa28.14■■■□□ 2.1
SNRNP25-201ENST00000293861 SSH2Q76I76 1423 aa28.14■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.14■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.13■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.11■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.11■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.1■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.1■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.1■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 NEUROD2Q15784 382 aa28.08■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SNRNP25-201ENST00000293861 PLIN1O60240 522 aa28.07■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 NWD1Q149M9 1564 aa28.07■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.06■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 FCHSD2O94868 740 aa28.06■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.06■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.05■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 FBLN1P23142 703 aa28.05■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.04■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.04■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 USP31Q70CQ4 1352 aa28.04■■■□□ 2.08
SNRNP25-201ENST00000293861 IL13P35225 146 aa28■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 CRBNQ96SW2 442 aa27.99■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.98■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 USP54Q70EL1 1684 aa27.98■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.97■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 IL16Q14005 1332 aa27.97■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 PIK3C2AO00443 1686 aa27.96■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.96■■■□□ 2.07
SNRNP25-201ENST00000293861 NEFMP07197 916 aa27.93■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 PEAK1Q9H792 1746 aa27.93■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 BCAR3O75815 825 aa27.92■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.92■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 PRKAR2BP31323 418 aa27.92■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 RIPK4P57078 832 aa27.91■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.9■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.89■■■□□ 2.06
SNRNP25-201ENST00000293861 RARSP54136 660 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE3AQ14432 1141 aa27.88■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.86■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 NFE2L2Q16236 605 aa27.86■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 C14orf37Q86TY3 774 aa27.86■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 HMOX1P09601 288 aa27.85■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 SBNO1A3KN83 1393 aa27.85■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRP6P59044 892 aa27.83■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 FLT4P35916 1363 aa27.83■■■□□ 2.05
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.83■■■□□ 2.05
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