RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 TMF1P82094 1093 aa31.29■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 AKAP12Q02952 1782 aa31.29■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 ILDR2Q71H61 639 aa31.27■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 ABCA3Q99758 1704 aa31.27■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 POTEAQ6S8J7 498 aa31.25■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 C8orf37Q96NL8 207 aa31.25■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa31.25■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 TMC1Q8TDI8 760 aa31.24■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHG5O94827 1062 aa31.24■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 AFF2P51816 1311 aa31.22■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 NUTM2GQ5VZR2 741 aa31.22■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 ABTB2Q8N961 1025 aa31.21■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa31.2■■■□□ 2.59
SYF2-201ENST00000236273 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 NGLY1Q96IV0 654 aa31.2■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 MON2Q7Z3U7 1717 aa31.19■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 NRKQ7Z2Y5 1582 aa31.19■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PP64 1363 aa31.17■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 NINLQ9Y2I6 1382 aa31.17■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 USP19O94966 1318 aa31.16■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 CDCA8Q53HL2 280 aa31.16■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 PIK3C2AO00443 1686 aa31.15■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 FAM83GA6ND36 823 aa31.14■■■□□ 2.58
SYF2-201ENST00000236273 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 TERF2IPQ9NYB0 399 aa31.13■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 BCL9LQ86UU0 1499 aa31.13■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 TTC21AQ8NDW8 1320 aa31.12■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 NLRP13Q86W25 1043 aa31.12■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 SLIT2O94813 1529 aa31.12■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 NLRP6P59044 892 aa31.1■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 MYOM1P52179 1685 aa31.09■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 USP21Q9UK80 565 aa31.09■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa31.08■■■□□ 2.57
SYF2-201ENST00000236273 GCP02774 474 aa31.07■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP31.07■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 ZRANB1Q9UGI0 708 aa31.07■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 SLIT3O75094 1523 aa31.05■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 NME9Q86XW9 330 aa31.05■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 USP31Q70CQ4 1352 aa31.04■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0232Q92628 1395 aa31.04■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 PLCH1Q4KWH8 1693 aa31.03■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 UNC5CLQ8IV45 518 aa31.02■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 ATRNO75882 1429 aa31.02■■■□□ 2.56
SYF2-201ENST00000236273 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 USP54Q70EL1 1684 aa31.01■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 CARD14Q9BXL6 1004 aa31■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 CPDO75976 1380 aa31■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 NWD2Q9ULI1 1742 aa31■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 CHRNA2Q15822 529 aa30.98■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.98■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 RXRBP28702 533 aa30.98■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 BTG4Q9NY30 223 aa30.98■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.97■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 NRAPQ86VF7 1730 aa30.95■■■□□ 2.55
SYF2-201ENST00000236273 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.94■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.94■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 NFAT5O94916 1531 aa30.93■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 FYB1O15117 783 aa30.93■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.93■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 KCNH5Q8NCM2 988 aa30.92■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 LMO7Q8WWI1 1683 aa30.92■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa30.91■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 VPS72Q15906 364 aa30.91■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF25Q86VW2 580 aa30.91■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 COL18A1P39060 1754 aa30.9■■■□□ 2.54
SYF2-201ENST00000236273 SOX12O15370 315 aa30.88■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 GLI3P10071 1580 aa30.88■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.87■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.86■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 PANK3Q9H999 370 aa30.86■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.85■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.85■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 RGS12O14924 1447 aa30.83■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 COG3Q96JB2 828 aa30.83■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.83■■■□□ 2.53
SYF2-201ENST00000236273 FBLN1P23142 703 aa30.81■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.8■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.8■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 CCDC7Q96M83 1385 aa30.8■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa30.8■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa30.8■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 SOCS7O14512 581 aa30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms