RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	GBE1	Q04446	702 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	APOF	Q13790	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SCYL1	Q96KG9	808 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	BTBD9	Q96Q07	612 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	KLF11	O14901	512 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	GLRA3	O75311	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	VDR	P11473	427 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	MX2	P20592	715 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP2F1	P24903	491 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	GTF2A2	P52657	109 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FOLH1	Q04609	750 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF358	Q9NW07	568 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CDH22	Q9UJ99	828 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	KDM1A	O60341	852 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TPPP	O94811	219 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	STBD1	O95210	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CRHR1	P34998	444 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ARL2	P36404	184 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CLCN3	P51790	818 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ACAP1	Q15027	740 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CA9	Q16790	459 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	IL23R	Q5VWK5	629 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	HPDL	Q96IR7	371 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CENPO	Q9BU64	300 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SERPINE1	P05121	402 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	MGAT1	P26572	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PML	P29590	882 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	NDST1	P52848	882 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PKNOX1	P55347	436 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FSTL1	Q12841	308 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ART3	Q13508	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TLR1	Q15399	786 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	EML3	Q32P44	896 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	POMP	Q9Y244	141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	TIMM44	O43615	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	USP12	O75317	370 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	LCP1	P13796	627 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF12	P17014	697 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSUH2-208	ENST00000455157	CDH3	P22223	829 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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