RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.14■□□□□ 0.97
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PTPRJ-208ENST00000615445 DPP7Q9UHL4 492 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-208ENST00000615445 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.975e-6■■■■■ 107.1
PTPRJ-208ENST00000615445 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-208ENST00000615445 AMHP03971 560 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-208ENST00000615445 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-208ENST00000615445 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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