RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 STK32CQ86UX6 486 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM160B2Q86V87 743 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 SFR1Q86XK3 245 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 DTX1Q86Y01 620 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 NELFCDQ8IXH7 590 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 MYCT1Q8N699 235 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 SUPT20HQ8NEM7 779 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 IL31RAQ8NI17 732 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 IFT81Q8WYA0 676 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC35C1Q96A29 364 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 CENPTQ96BT3 561 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 HVCN1Q96D96 273 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 HES6Q96HZ4 224 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 KIRREL1Q96J84 757 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 WDR92Q96MX6 357 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 ZIM3Q96PE6 472 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 UIMC1Q96RL1 719 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 RIT2Q99578 217 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 REEP2Q9BRK0 252 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 CPVLQ9H3G5 476 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM206Q9H813 350 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 TMBIM4Q9HC24 238 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 CASS4Q9NQ75 786 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 LCMT1Q9UIC8 334 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 CROTQ9UKG9 612 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 MTUS1Q9ULD2 1270 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 PADI4Q9UM07 663 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 NFU1Q9UMS0 254 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 WASF3Q9UPY6 502 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 LZTS1Q9Y250 596 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM169AQ9Y6X4 670 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 NRXN2Q9P2S2 1712 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 GRIN2DO15399 1336 aa4.97□□□□□ -1.61
CYCSP28-201ENST00000534284 A0A0G2JNJ9 132 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 F5H6K3 240 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 F8VZ95 297 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 RAD51CO43502 376 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 FRS3O43559 492 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM127O75204 238 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 MTA2O94776 668 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 IL18RAPO95256 599 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 IL18BPO95998 194 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 NUDT17P0C025 328 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 POLR2MP0CAP2 368 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 GZMAP12544 262 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 EEF2P13639 858 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 TYRP14679 529 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 TNFAIP3P21580 790 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP5DP30049 168 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 CHRNA3P32297 505 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 CXCR5P32302 372 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 MDH1P40925 334 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 FMO5P49326 533 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 CARSP49589 748 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 PRELPP51888 382 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 STAT2P52630 851 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 PTENP60484 403 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 MYL7Q01449 175 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 KLRC3Q07444 240 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 IFFO1Q0D2I5 559 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 IKQ13123 557 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 KIF22Q14807 665 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 RAB39AQ14964 217 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 SLMAPQ14BN4 828 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 STILQ15468 1287 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 CNGA2Q16280 664 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 PTGISQ16647 500 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC38Q502W7 563 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 FKBP1CQ5VVH2 108 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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