RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RAD51C	O43502	376 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GAS8	O95995	478 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MX2	P20592	715 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TACR2	P21452	398 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NDST2	P52849	883 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ZXDB	P98169	803 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PDK1	Q15118	436 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TSGA13	Q96PP4	275 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MCF2L	O15068	1137 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ECEL1	O95672	775 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GLP2R	O95838	553 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RBP3	P10745	1247 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CHKA	P35790	457 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	AVPR1A	P37288	418 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MAPKAPK2	P49137	400 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP4F8	P98187	520 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TFF2	Q03403	129 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GBE1	Q04446	702 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TEAD2	Q15562	447 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CHST9	Q7L1S5	443 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	JAML	Q86YT9	394 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	IFT20	Q8IY31	132 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	HLA-C	Q95604	372 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB17	Q9H0T7	212 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	OBP2A	Q9NY56	170 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529		F5H5T6	163 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	LEFTY2	O00292	366 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NDC80	O14777	642 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MTSS1	O43312	755 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN11	O75508	207 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CKM	P06732	381 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	HMBS	P08397	361 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	IVD	P26440	423 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNJ1	P48048	391 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CDH4	P55283	916 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT2	Q10471	571 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CUL1	Q13616	776 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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