RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 POU5F2Q8N7G0 328 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 TSC2P49815 1807 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 MYBPHLA2RUH7 354 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 RRN3P2A6NIE6 340 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PDHA1P08559 390 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 USP17L7P0C7H9 530 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ERCC2P18074 760 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PAX7P23759 505 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ADAM17P78536 824 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 DEUP1Q05D60 604 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 DPYSQ14117 519 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 KRT72Q14CN4 511 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ATG16L1Q676U5 607 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 TLK2Q86UE8 772 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 RASSF3Q86WH2 238 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 CRLF3Q8IUI8 442 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 NT5C3BQ969T7 300 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 MTBPQ96DY7 904 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 FAM161BQ96MY7 647 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 MKS1Q9NXB0 559 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 DCLK1O15075 740 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 DAB1O75553 588 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 CD4P01730 458 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 MYL3P08590 195 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 TPH1P17752 444 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PGM1P36871 562 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 IRF9Q00978 393 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 TUBB3Q13509 450 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 BNIPLQ7Z465 357 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ZNF560Q96MR9 790 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 MIOSQ9NXC5 875 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PLIN3O60664 434 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 KCNE1P15382 129 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ACADSBP45954 432 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB17Q13105 803 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 IQSEC1Q6DN90 963 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 MFSD3Q96ES6 412 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SMOQ99835 787 aa15.99■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 CAPN9O14815 690 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 GSTA2P09210 222 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PGAM1P18669 254 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PTPN3P26045 913 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 CD68P34810 354 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 NOS2P35228 1153 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 FDFT1P37268 417 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 TUBP50607 506 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SNX16P57768 344 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 PDE1BQ01064 536 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SV2CQ496J9 727 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 XKR4Q5GH76 650 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ARCQ7LC44 396 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 AGR3Q8TD06 166 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SORT1Q99523 831 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 LRRC42Q9Y546 428 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ATP9BO43861 1147 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SLC1A6P48664 564 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 GLUD2P49448 558 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SERPINB9P50453 376 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ANO7Q6IWH7 933 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 WNT8BQ93098 351 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 TNIP3Q96KP6 325 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.98■□□□□ 0.15
NISCH-202ENST00000420808 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.151e-6■■□□□ 13.2
NISCH-202ENST00000420808 ZFATQ9P243 1243 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms