RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 FRMD1Q8N878 549 aa31.69■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 CFAP57Q96MR6 1250 aa31.69■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 TKTL2Q9H0I9 626 aa31.69■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 WDCPQ9H6R7 721 aa31.69■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ADAM22Q9P0K1 906 aa31.69■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 HS3ST4Q9Y661 456 aa31.69■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 LRRC53A6NM62 1247 aa31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ADCY5O95622 1261 aa31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 FANCCQ00597 558 aa31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 AUHQ13825 339 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 FBXL22Q6P050 247 aa31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 MRGPRX1Q96LB2 322 aa31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 SEMA4GQ9NTN9 838 aa31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 VANGL2Q9ULK5 521 aa31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa31.68■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 MAP3K13O43283 966 aa31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 DLDP09622 509 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 HLA-EP13747 358 aa31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 PTP4A2Q12974 167 aa31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 NR1I3Q14994 352 aa31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 PTPRNQ16849 979 aa31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ARCQ7LC44 396 aa31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 SIK2Q9H0K1 926 aa31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ABCA7Q8IZY2 2146 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 CALB1P05937 261 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 CSKP41240 450 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 CCDC6Q16204 474 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ASIC2Q16515 512 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 PITRM1Q5JRX3 1037 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 IGSF8Q969P0 613 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ANLNQ9NQW6 1124 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 CKAP5Q14008 2032 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 A0A1B0GVM2 712 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 TCAF2A6NFQ2 919 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 MOCS3O95396 460 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 GJB6O95452 261 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 RDXP35241 583 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 C14orf80Q86SX3 495 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ZNF366Q8N895 744 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 TTC17Q96AE7 1141 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 TMEM245Q9H330 911 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 TMEM51Q9NW97 253 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 CYP8B1Q9UNU6 501 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 THADAQ6YHU6 1953 aa31.65■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ZNF217O75362 1048 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 MPLP40238 635 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 GSCP56915 257 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 ATP11AP98196 1134 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 CREB5Q02930 508 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 LMNB2Q03252 620 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 CSRP2Q16527 193 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 MON1BQ7L1V2 547 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 LPCAT2Q7L5N7 544 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 JOSD2Q8TAC2 188 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 RXFP2Q8WXD0 754 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 SELENOOQ9BVL4 669 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80B-201ENST00000233331 I6L893 689 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 ASLP04424 464 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 TNFAIP3P21580 790 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 SDC4P31431 198 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 IRAK1P51617 712 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 UBASH3AP57075 661 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 SFMBT2Q5VUG0 894 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 PRR23CQ6ZRP0 262 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 BNIPLQ7Z465 357 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 FAM131BQ86XD5 332 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 TTYH3Q9C0H2 523 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 CD93Q9NPY3 652 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 SNX10Q9Y5X0 201 aa31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa31.62■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa31.62■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 KRT3P12035 628 aa31.62■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 PDGFRAP16234 1089 aa31.62■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 ST8SIA6P61647 398 aa31.62■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 CDO1Q16878 200 aa31.62■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 PLEKHG6Q3KR16 790 aa31.62■■■□□ 2.65
INO80B-201ENST00000233331 CACUL1Q86Y37 369 aa31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms