RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 CHN1P15882 459 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PTPN2P17706 415 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 IL13P35225 146 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ADMP35318 185 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 THBS4P35443 961 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 MTHFRP42898 656 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 KIR2DL3P43628 341 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 GATMP50440 423 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PGDP52209 483 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PSMC6P62333 389 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 IKZF1Q13422 519 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ALCAMQ13740 583 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 IRF3Q14653 427 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PCLAFQ15004 111 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 GRIK4Q16099 956 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ALG11Q2TAA5 492 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 MED25Q71SY5 747 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 LDHDQ86WU2 507 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 HDDC3Q8N4P3 179 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 FITM2Q8N6M3 262 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 IQUBQ8NA54 791 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 MOAP1Q96BY2 351 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 DACH2Q96NX9 599 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 SMOQ99835 787 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 G6PC3Q9BUM1 346 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 MECRQ9BV79 373 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 TASP1Q9H6P5 420 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ANO10Q9NW15 660 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ING3Q9NXR8 418 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PSD3Q9NYI0 1048 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 HESX1Q9UBX0 185 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 IL19Q9UHD0 177 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 TSPYL4Q9UJ04 414 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 OSGIN1Q9UJX0 560 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 RAD54BQ9Y620 910 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNM1LO00429 736 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF213O14771 459 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 N4BP3O15049 544 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 TSC22D2O75157 780 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 AGFG2O95081 481 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 MPOP05164 745 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 URODP06132 367 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 DBHP09172 617 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 SRCP12931 536 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 SELLP14151 372 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 CD19P15391 556 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PNLIPP16233 465 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRT4P19013 534 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 CASTP20810 708 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 RBL1P28749 1068 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 NOS3P29474 1203 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 SOAT1P35610 550 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PBX3P40426 434 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 GSK3AP49840 483 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 RCAN1P53805 252 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 EPHB3P54753 998 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 STX1BP61266 288 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 DDR1Q08345 913 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 NIPAL4Q0D2K0 466 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCNIQ14094 377 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLCA4Q14CN2 919 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 GPR162Q16538 588 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms