RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGAV	P06756	1048 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ERCC2	P18074	760 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	AMPD1	P23109	780 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CCR2	P41597	374 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PTGIR	P43119	386 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC11A2	P49281	568 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	P3H4	Q92791	437 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT12	Q99456	494 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	NACA2	Q9H009	215 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CREB3	O43889	395 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	KLKB1	P03952	638 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	MYL4	P12829	197 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	RHOQ	P17081	205 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNQ1	P51787	676 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TPI1	P60174	286 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	HYAL1	Q12794	435 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	KAZN	Q674X7	775 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZNB5	142 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TRANK1	O15050	2925 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PRU2	124 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529		E9PAM4	449 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DAPK3	O43293	454 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MCM3	P25205	808 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	EPHB2	P29323	1055 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINB6	P35237	376 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	DR1	Q01658	176 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	C8orf74	Q6P047	294 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXL22	Q6P050	247 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	FATE1	Q969F0	183 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ERP44	Q9BS26	406 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	SIK2	Q9H0K1	926 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.14	□□□□□ -0.31

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