RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NEDD9Q14511 834 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SEMA3AQ14563 771 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ODF1Q14990 250 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRT72Q14CN4 511 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VEPH1Q14D04 833 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACOX1Q15067 660 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GPR68Q15743 365 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACCSLQ4AC99 568 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GXYLT1Q4G148 440 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FSCBQ5H9T9 825 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM196Q5HYL7 178 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SYCP2LQ5T4T6 812 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VPS53Q5VIR6 699 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM171A1Q5VUB5 890 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KIAA0895LQ68EN5 471 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC18B1Q6NT16 456 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AADACL2Q6P093 401 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CRTC1Q6UUV9 634 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PCSK4Q6UW60 755 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 B3GNT9Q6UX72 402 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF788Q6ZQV5 615 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COLCA1Q6ZS62 124 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C14orf80Q86SX3 495 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRABD2AQ86V40 505 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EXOC3L1Q86VI1 746 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC25Q86WR0 208 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRIMA1Q86XR5 153 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LDLRAD3Q86YD5 345 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C2CD5Q86YS7 1000 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC28AQ8IWP9 274 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ADHFE1Q8IWW8 467 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC105Q8IYK2 499 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DSELQ8IZU8 1212 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FBXL14Q8N1E6 418 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TTC30BQ8N4P2 665 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM199Q8N511 208 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VGLL2Q8N8G2 317 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C11orf44Q8N8P7 122 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CNBD1Q8NA66 436 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PPFIBP2Q8ND30 876 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TNIP2Q8NFZ5 429 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RDM1Q8NG50 284 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR6Y1Q8NGX8 325 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR14A16Q8NHC5 309 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SVIPQ8NHG7 77 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PPP1R35Q8TAP8 253 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM71BQ8TC56 605 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAGEC3Q8TD91 643 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC35F5Q8WV83 523 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ASB12Q8WXK4 309 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 THAP4Q8WY91 577 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 POMGNT1Q8WZA1 660 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SDCCAG3Q96C92 435 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ERLEC1Q96DZ1 483 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MRGPRX1Q96LB2 322 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DUX5Q96PT3 197 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRR25Q96S07 402 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPS6KC1Q96S38 1066 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TBCBQ99426 244 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ADAM2Q99965 735 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLX1AQ9BQ83 275 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HERPUD2Q9BSE4 406 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EFHD1Q9BUP0 239 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 APOL5Q9BWW9 433 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C22orf23Q9BZE7 217 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TM6SF1Q9BZW5 370 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRSS22Q9GZN4 317 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VPS16Q9H269 839 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UNC45AQ9H3U1 944 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SMOC2Q9H3U7 446 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KAT14Q9H8E8 782 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FKRPQ9H9S5 495 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PDE11AQ9HCR9 933 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CHST12Q9NRB3 414 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC52A1Q9NWF4 448 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BABAM1Q9NWV8 329 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IRAK4Q9NWZ3 460 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms