RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439424.6

C17orf49-201, Transcript of chromosome 17 open reading frame 49, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C17orf49, Length 850 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf49-201ENST00000439424 GLI1P08151 1106 aa24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 GABRG2P18507 467 aa24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 HLA-FP30511 346 aa24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 RNF43Q68DV7 783 aa24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 RLN3Q8WXF3 142 aa24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 SORCS1Q8WY21 1168 aa24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 AZIN2Q96A70 460 aa24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 EPN2O95208 641 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 IL12RB1P42701 662 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 SLC6A3Q01959 620 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 CIPCQ9C0C6 399 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 ABCB8Q9NUT2 735 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 COX16Q9P0S2 106 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 STON1Q9Y6Q2 735 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 APOEP02649 317 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 GBP1P32455 592 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 SOX5P35711 763 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 RPS24P62847 133 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 NOMO3P69849 1222 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 UBXN1Q04323 297 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 CCDC6Q16204 474 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 C2CD6Q53TS8 623 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 PGBD3Q8N328 593 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 FRMD1Q8N878 549 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 SLC6A17Q9H1V8 727 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 DDIT4Q9NX09 232 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 ELOVL2Q9NXB9 296 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 STIM2Q9P246 746 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 LAMA1P25391 3075 aa24.96■■□□□ 1.59
C17orf49-201ENST00000439424 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 NDUFV2P19404 249 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 P2RY2P41231 377 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 CDK17Q00537 523 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 ZNF234Q14588 700 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 NAA35Q5VZE5 725 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 SDE2Q6IQ49 451 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 SPAG5Q96R06 1193 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 SEMA4GQ9NTN9 838 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 GGA2Q9UJY4 613 aa24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 DOCK4Q8N1I0 1966 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 PI4KAP42356 2102 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 LRP3O75074 770 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 CHRNB2P17787 502 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 CD70P32970 193 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 GABRB2P47870 512 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 FMO1Q01740 532 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 ENPP2Q13822 863 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 ELF2Q15723 593 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 MAP7D1Q3KQU3 841 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 MPP7Q5T2T1 576 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 PMS2CLQ68D20 193 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 CHST9Q7L1S5 443 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 CHSY1Q86X52 802 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 XYLT1Q86Y38 959 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 CFAP52Q8N1V2 620 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 NEK11Q8NG66 645 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 UCMAQ8WVF2 138 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 RMDN1Q96DB5 314 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 LOXL4Q96JB6 756 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 CD93Q9NPY3 652 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 DNAH14Q0VDD8 3507 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 PRKCHP24723 683 aa24.93■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 SNX16P57768 344 aa24.93■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.93■■□□□ 1.58
C17orf49-201ENST00000439424 ADIPOR2Q86V24 386 aa24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms