RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 WHRNQ9P202 907 aa18.49■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 CYP2C18P33260 490 aa18.49■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 DDR2Q16832 855 aa18.49■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 SLC39A12Q504Y0 691 aa18.49■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.49■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.49■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.49■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.49■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 KBTBD13C9JR72 458 aa18.48■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 LGMNQ99538 433 aa18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 RMI1Q9H9A7 625 aa18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 NINJ2Q9NZG7 142 aa18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 SCN5AQ14524 2016 aa18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 MATKP42679 507 aa18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 COPS2P61201 443 aa18.48■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 MTMR3Q13615 1198 aa18.48■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 SELENOSQ9BQE4 189 aa18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 RGS18Q9NS28 235 aa18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 PHF24Q9UPV7 400 aa18.48■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM63AO94886 807 aa18.48■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 ZBED8Q8IZ13 594 aa18.48■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 HHLA1C9JL84 531 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 CSPG5O95196 566 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 APOC2P02655 101 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 RARGP13631 454 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 CHN1P15882 459 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 TAZQ16635 292 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 LONP2Q86WA8 852 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 CYP4X1Q8N118 509 aa18.47■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 CPT1BQ92523 772 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 HSFY1Q96LI6 401 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa18.47■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 MCF2LO15068 1137 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 NOMO2Q5JPE7 1267 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 DDIT4Q9NX09 232 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 CEP290O15078 2479 aa18.47■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 REV3LO60673 3130 aa18.46■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 ENDOD1O94919 500 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 FAM26DQ5JW98 314 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 TAS1R1Q7RTX1 841 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 FAM126BQ8IXS8 530 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 PGBD4Q96DM1 585 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 GALNT8Q9NY28 637 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 ENPP3O14638 875 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 CABYRO75952 493 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 ITGAVP06756 1048 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 RPL9P32969 192 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 OLIG2Q13516 323 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 BOLA3Q53S33 107 aa18.46■□□□□ 0.55
PDE4D-204ENST00000358923 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
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PDE4D-204ENST00000358923 SLC25A52Q3SY17 297 aa18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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PDE4D-204ENST00000358923 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 DPYSL4O14531 572 aa18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 APOL1O14791 398 aa18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 WFS1O76024 890 aa18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 ZBED1O96006 694 aa18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 SELPP16109 830 aa18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 SSTR1P30872 391 aa18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 ROR1Q01973 937 aa18.45■□□□□ 0.54
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PDE4D-204ENST00000358923 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.45■□□□□ 0.54
PDE4D-204ENST00000358923 IGDCC3Q8IVU1 814 aa18.45■□□□□ 0.54
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