RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554186.1

LINC00520-201, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00520, Length 831 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-201ENST00000554186 PRPHP41219 470 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 TECP42680 631 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 WNT3AP56704 352 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 KRT85P78386 507 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PRKCZQ05513 592 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 ARHGAP1Q07960 439 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SCAPQ12770 1279 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 LY6KQ17RY6 165 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 CEP55Q53EZ4 464 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 HYIQ5T013 277 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 GPR158Q5T848 1215 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 METRNLQ641Q3 311 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 ARMCX2Q7L311 632 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 NIPA1Q7RTP0 329 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SLC44A3Q8N4M1 653 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 RNF169Q8NCN4 708 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 TRIB2Q92519 343 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 RPS6KC1Q96S38 1066 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PANK2Q9BZ23 570 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 RGL1Q9NZL6 768 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PNMA2Q9UL42 364 aa4.75□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 EVPLQ92817 2033 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 TBX3O15119 743 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 STRNO43815 780 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 KLRC4O43908 158 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 NEMFO60524 1076 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 ESRRBO95718 433 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 OR52Z1P0C646 297 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 FCER1AP12319 257 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 XBP1P17861 261 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 CYP2B6P20813 491 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 MAPK4P31152 587 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 LSP1P33241 339 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PSMC4P43686 418 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 FLT3LGP49771 235 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 DSG1Q02413 1049 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SREBF2Q12772 1141 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PPP2R5CQ13362 524 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 TRIM29Q14134 588 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PDIA5Q14554 519 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 CATSPER3Q86XQ3 398 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SPATA20Q8TB22 786 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 BICD2Q8TD16 824 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 STAMQ92783 540 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 MFSD3Q96ES6 412 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 IWS1Q96ST2 819 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PLIN2Q99541 437 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 POLD4Q9HCU8 107 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 FBXO40Q9UH90 709 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 KCNG1Q9UIX4 513 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 KIF3AQ9Y496 699 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SIP14410 1827 aa4.74□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 PFASO15067 1338 aa4.73□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 GRIN2DO15399 1336 aa4.73□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 NFASCO94856 1347 aa4.73□□□□□ -1.65
LINC00520-201ENST00000554186 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms