RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	COCH	O43405	550 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBB	P07437	444 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	EPCAM	P16422	314 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	WEE1	P30291	646 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	HOXC13	P31276	330 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRNA3	P32297	505 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CA8	P35219	290 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	NR2C2	P49116	596 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC7A9	P82251	487 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CA9	Q16790	459 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	C5orf22	Q49AR2	442 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	AADACL2	Q6P093	401 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	HSPH1	Q92598	858 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BRJ5	948 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	LATS1	O95835	1130 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TBX18	O95935	607 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	APOC2	P02655	101 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CD48	P09326	243 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TGM2	P21980	687 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL4A	P40617	200 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	FNTA	P49354	379 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT81	Q14533	505 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	RUBCN	Q92622	972 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PLD4	Q96BZ4	506 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	DRGX	A6NNA5	263 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	WASH4P	A8MWX3	477 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF197	O14709	1029 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CST8	O60676	142 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PHF2	O75151	1096 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PAGE1	O75459	146 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	APOE	P02649	317 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT10	P13645	584 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	TCF3	P15923	654 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	HDC	P19113	662 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	GABRR2	P28476	465 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	DPYS	Q14117	519 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TRAF4-208	ENST00000469529	UBXN4	Q92575	508 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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