RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CIPCQ9C0C6 399 aa27.34■■□□□ 1.97
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN3O60637 253 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMP6P22004 513 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF445P59923 1031 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF234Q14588 700 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STILQ15468 1287 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST3GAL2Q16842 350 aa27.33■■□□□ 1.97
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMO3Q8TAP4 145 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35F5Q8WV83 523 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTNND2Q9UQB3 1225 aa27.33■■□□□ 1.97
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LATS1O95835 1130 aa27.32■■□□□ 1.96
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARID5AQ03989 594 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MORC3Q14149 939 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMF1Q6P1K2 205 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRGQQ8WZA9 623 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSWIM1Q9BR11 485 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPN10Q9HC96 672 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FSCN3Q9NQT6 498 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STOML2Q9UJZ1 356 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3R2O00459 728 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSI1O43347 362 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD6P30203 668 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYCP2LQ5T4T6 812 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRF1Q5T601 910 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSANTD2Q6P1R3 559 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRAGAQ7L523 313 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGL4Q8IZJ4 473 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB124Q8NES8 71 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SORCS1Q8WY21 1168 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXJ1Q92949 421 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABBR2O75899 941 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNA14O95837 355 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCNT1Q02742 428 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM215Q68D42 235 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF19Q8IW93 802 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM59Q8IWR1 403 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EHBP1Q8NDI1 1231 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA1Q92805 767 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC32A1Q9H598 525 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITM2CQ9NQX7 267 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALCAP01258 141 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKCHP24723 683 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX17P56962 302 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNH2Q12809 1159 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMPRSS6Q8IU80 811 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDDC3Q8N4P3 179 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIPA1Q96FS4 1042 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSFY1Q96LI6 401 aa27.29■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP33O14559 1287 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTFP02788 710 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPHX1P07099 455 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCAM1P13591 858 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-FP30511 346 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXC1Q12948 553 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAK1Q13153 545 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR45BQ5MNZ6 344 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUSD2Q9UGT4 822 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP24Q9UPU5 2620 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT37O76014 449 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO21O94952 628 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFPP02771 609 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYPP08247 313 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OXTRP30559 389 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARSP56192 900 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA3BQ13214 749 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC45BQ8IWX7 931 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC4CQ8WTT0 213 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIS12Q9H081 205 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCB8Q9NUT2 735 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDH15Q96QU1 1955 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UPK3BL1B0FP48 263 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ18B7U540 433 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UPK3BL2E5RIL1 263 aa27.26■■□□□ 1.95
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