RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 CYP4F2P78329 520 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TLE2Q04725 743 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TLE3Q04726 772 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ABHD18Q0P651 414 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PDCLQ13371 301 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 DCTN1Q14203 1278 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PCID2Q5JVF3 399 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 BBS12Q6ZW61 710 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TEX19Q8NA77 164 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 KAZALD1Q96I82 304 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TWNKQ96RR1 684 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 MMS19Q96T76 1030 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PRRX2Q99811 253 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CIPCQ9C0C6 399 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 USP29Q9HBJ7 922 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 FZD4Q9ULV1 537 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 CRYL1Q9Y2S2 319 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 DERAQ9Y315 318 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3EA0A087X179 549 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3BA6NDS4 549 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 AGAP5A6NIR3 686 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3LB9A6J9 549 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3HP0C7X1 549 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TACR2P21452 398 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 DUSP1P28562 367 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 GRK5P34947 590 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PLA2G5P39877 138 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CCR5P51681 352 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 JAK3P52333 1124 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CFHR3Q02985 330 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 UBE3AQ05086 875 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SLC12A1Q13621 1099 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 WDR93Q6P2C0 686 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 Q8N1X5 172 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TERB1Q8NA31 727 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 NAXEQ8NCW5 288 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PPM1MQ96MI6 270 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 NOD2Q9HC29 1040 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM160Q9NX00 188 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ASIC5Q9NY37 505 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 BAG5Q9UL15 447 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 VPS4AQ9UN37 437 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SLC12A4Q9UP95 1085 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 RCE1Q9Y256 329 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 STX16O14662 325 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 FOXN1O15353 648 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 MT-CO3P00414 261 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 C1RP00736 705 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PEPDP12955 493 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 C6P13671 934 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 IGFBP2P18065 325 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CXCR5P32302 372 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 COPB1P53618 953 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 RCAN1P53805 252 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 VAMP2P63027 116 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CHRNDQ07001 517 aa3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms