RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 OR51B5Q9H339 312 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MVB12BQ9H7P6 319 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PIM2Q9P1W9 311 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 LRWD1Q9UFC0 647 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CTAGE9A4FU28 777 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TRPC5OSA6NMA1 111 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TARM1B6A8C7 271 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GABBR2O75899 941 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TDP2O95551 362 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 NDUFB10O96000 172 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ASS1P00966 412 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 APOA4P06727 396 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 KRT5P13647 590 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GFAPP14136 432 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CASP14P31944 242 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ECT2LQ008S8 904 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SNTA1Q13424 505 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TRPC3Q13507 836 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PARP6Q2NL67 630 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ZACNQ401N2 412 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GALNTL6Q49A17 601 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 KRT79Q5XKE5 535 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM139Q8IV31 216 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 AMNQ9BXJ7 453 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 HSD3B7Q9H2F3 369 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 QSER1Q2KHR3 1735 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 OR6C74A6NCV1 312 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 C16orf96A6NNT2 1141 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L15C9J2P7 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L11C9JVI0 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L18D6R9N7 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L22D6RA61 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L19D6RCP7 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L20D6RJB6 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PSMA7O14818 248 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 VILLO15195 856 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 FAM228BP0C875 321 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 BMP3P12645 472 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ATP6V1B1P15313 513 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 DRD4P21917 467 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 COG7P83436 770 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ZBTB16Q05516 673 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L24Q0WX57 530 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 AP3B2Q13367 1082 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 HERC3Q15034 1050 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 UGP2Q16851 508 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 RGS21Q2M5E4 152 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 EMBQ6PCB8 327 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 WDR49Q8IV35 697 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 P3H2Q8IVL5 708 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CARFQ8N187 725 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 DNAAF3Q8N9W5 541 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 AGR3Q8TD06 166 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 RNF139Q8WU17 664 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 FOXJ1Q92949 421 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 NTMT1Q9BV86 223 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CUEDC2Q9H467 287 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC19Q9H756 370 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ECT2Q9H8V3 914 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GLRX2Q9NS18 164 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 COG5Q9UP83 839 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 FOCADQ5VW36 1801 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 POTEMA6NI47 508 aa5.1□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SLC37A4O43826 429 aa5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms