RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SRGAP2BP0DMP2 458 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 RBP3P10745 1247 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 TPSB2P20231 275 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 PTGER2P43116 358 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 CDKL1Q00532 357 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 TPSAB1Q15661 275 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 C4orf22Q6V702 233 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 LDHDQ86WU2 507 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 DLG3Q92796 817 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 CFAP36Q96G28 342 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 RANBP9Q96S59 729 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 RSAD1Q9HA92 442 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 CDH7Q9ULB5 785 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 TRIM64A6NGJ6 449 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 WDR64B1ANS9 1081 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ASS1P00966 412 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 GALK1P51570 392 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 DYNLT1P63172 113 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 TUBA4AP68366 448 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 PFKPQ01813 784 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 CBX3Q13185 183 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 NAB1Q13506 487 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 BMPR2Q13873 1038 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 GK3PQ14409 553 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 XKR9Q5GH70 373 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 FAM47CQ5HY64 1035 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 DCUN1D2Q6PH85 259 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 CARM1Q86X55 608 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 NDUFAF2Q8N183 169 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 JOSD2Q8TAC2 188 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 RIN3Q8TB24 985 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 CHURC1Q8WUH1 139 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 APOL6Q9BWW8 343 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 SLC9A2Q9UBY0 812 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 LCTP09848 1927 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB14O43829 449 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ICAM1P05362 532 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 PSMA2P25787 234 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 SERPINB6P35237 376 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 PSMD8P48556 350 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 EPHB1P54762 984 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 KRT76Q01546 638 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 KCNC4Q03721 635 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 GRAMD1BQ3KR37 738 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ZNF597Q96LX8 424 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 CYP26B1Q9NR63 512 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ZBED1O96006 694 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 NRLP54845 237 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 KLF10Q13118 480 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 MTMR1Q13613 665 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 HERC3Q15034 1050 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 CNGA3Q16281 694 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 PTPN20Q4JDL3 420 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 PHTF2Q8N3S3 785 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 CYTH4Q9UIA0 394 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 FEM1BQ9UK73 627 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 RNF11Q9Y3C5 154 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ZNF487B1APH4 448 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 H3BSA7 217 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 STAM2O75886 525 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 BMP10O95393 424 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 PORP16435 677 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 AP3M2P53677 418 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 MTMR2Q13614 643 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 DPYSQ14117 519 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 POTEHQ6S545 545 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 XYLT1Q86Y38 959 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 RFX6Q8HWS3 928 aa10.2□□□□□ -0.78
HCG18-242ENST00000602319 MAP7D3Q8IWC1 876 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.6 ms