RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439424.6

C17orf49-201, Transcript of chromosome 17 open reading frame 49, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C17orf49, Length 850 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf49-201ENST00000439424 CPXM2Q8N436 756 aa25.1■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 TSTD1Q8NFU3 115 aa25.1■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 GOLGA1Q92805 767 aa25.1■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 FAM149B1Q96BN6 582 aa25.1■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 PCDHGC3Q9UN70 934 aa25.1■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 ABCA7Q8IZY2 2146 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 CKAP5Q14008 2032 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 PRRT4C9JH25 899 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 AXIN1O15169 862 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 ADAM23O75077 832 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 CISD3P0C7P0 127 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 NCAM1P13591 858 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 CNR2P34972 360 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 DGKGP49619 791 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 MYL5Q02045 173 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 PTK2Q05397 1052 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 CRY1Q16526 586 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 TMEM110Q86TL2 294 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 GAB3Q8WWW8 586 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 CPXM1Q96SM3 734 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 RAB23Q9ULC3 237 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 RPP40O75818 363 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 UCHL3P15374 230 aa25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 HARS2P49590 506 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 TYRO3Q06418 890 aa25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 CEP68Q76N32 757 aa25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 KIAA2013Q8IYS2 634 aa25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 TPSD1Q9BZJ3 242 aa25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 GANQ9H2C0 597 aa25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 FBXO10Q9UK96 956 aa25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 CLEC4EQ9ULY5 219 aa25.08■■□□□ 1.61
C17orf49-201ENST00000439424 SART1O43290 800 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 TSPAN3O60637 253 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 NCAPHQ15003 741 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 SYPL2Q5VXT5 272 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 ANO7Q6IWH7 933 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 TAC4Q86UU9 113 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 MDGA1Q8NFP4 955 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 ADAM32Q8TC27 787 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 EBF1Q9UH73 591 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 CEP250Q9BV73 2442 aa25.07■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 GFRA2O00451 464 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 WASP42768 502 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 SGSHP51688 502 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 DGKEP52429 567 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 TBX4P57082 545 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 TAF5Q15542 800 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 EOGTQ5NDL2 527 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 RASSF3Q86WH2 238 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 ACOX2Q99424 681 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 LHX5Q9H2C1 402 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 STOML2Q9UJZ1 356 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 STARD13Q9Y3M8 1113 aa25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 FAM170AA1A519 330 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 F8VZ95 297 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 EPHB6O15197 1021 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 LATS1O95835 1130 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 CYBBP04839 570 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 GEN1Q17RS7 908 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 PTPN20Q4JDL3 420 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 KBTBD6Q86V97 674 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 DDI1Q8WTU0 396 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 PARD6AQ9NPB6 346 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 GMEB2Q9UKD1 530 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 DCHS1Q96JQ0 3298 aa25.05■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 DCLK1O15075 740 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 ERBB2P04626 1255 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 CYP11B1P15538 503 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 ZNF18P17022 549 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 KRT9P35527 623 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 RING1Q06587 406 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 ADGRF1Q5T601 910 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 SERPINB11Q96P15 392 aa25.04■■□□□ 1.6
C17orf49-201ENST00000439424 POPDC2Q9HBU9 364 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms