RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ARHGAP42A6NI28 874 aa10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 SLC22A2O15244 555 aa10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 ARRB2P32121 409 aa10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 SLC1A6P48664 564 aa10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 ACAP1Q15027 740 aa10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 LRRC36Q1X8D7 754 aa10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 KLHL35Q6PF15 583 aa10.23□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 SLC35B4Q969S0 331 aa10.23□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 KITP10721 976 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 COX4I1P13073 169 aa10.22□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF423Q2M1K9 1284 aa10.22□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 RILPQ96NA2 401 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.22□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 UGT1A7Q9HAW7 530 aa10.22□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 UGT1A8Q9HAW9 530 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 PCDH18Q9HCL0 1135 aa10.22□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 KLC2Q9H0B6 622 aa10.22□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 PTF1AQ7RTS3 328 aa10.22□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.22□□□□□ -0.77
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HCG18-242ENST00000602319 USP6NLQ92738 828 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 SIGLEC10Q96LC7 697 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 SQORQ9Y6N5 450 aa10.22□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 TRIM64BA6NI03 449 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 PLIN3O60664 434 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 GLRA3O75311 464 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 AVILO75366 819 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 ALDH2P05091 517 aa10.21□□□□□ -0.77
HCG18-242ENST00000602319 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.21□□□□□ -0.77
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