RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF333Q96JL9 665 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 RUBCNLQ9H714 662 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ITM2BQ9Y287 266 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF711Q9Y462 761 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 CCDC126Q96EE4 140 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 A0A1B0GUA9 196 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMAD4-212ENST00000591126 NDUFA9Q16795 377 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 EID3Q8N140 333 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CD101Q93033 1021 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 MTBPQ96DY7 904 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SCLYQ96I15 445 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-212ENST00000591126 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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