RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 PRPSAP2O60256 369 aa18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 SDC4P31431 198 aa18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 SCNN1BP51168 640 aa18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 UNC45BQ8IWX7 931 aa18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 EDEM1Q92611 657 aa18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 C9orf72Q96LT7 481 aa18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 TBCBQ99426 244 aa18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.59■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 CNPY3Q9BT09 278 aa18.59■□□□□ 0.57
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PDE4D-204ENST00000358923 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
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PDE4D-204ENST00000358923 CD300LGQ6UXG3 332 aa18.58■□□□□ 0.57
PDE4D-204ENST00000358923 UNC93AQ86WB7 457 aa18.58■□□□□ 0.57
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PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.58■□□□□ 0.57
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PDE4D-204ENST00000358923 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.58■□□□□ 0.56
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PDE4D-204ENST00000358923 CALCOCO2Q13137 446 aa18.58■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 CCNG2Q16589 344 aa18.58■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 HADHQ16836 314 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
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PDE4D-204ENST00000358923 DEFB106AQ8N104 65 aa18.58■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 SYT15Q9BQS2 421 aa18.58■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
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PDE4D-204ENST00000358923 EYSQ5T1H1 3165 aa18.58■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 ATF2P15336 505 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 IL4RP24394 825 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 NUMBP49757 651 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 PGFP49763 221 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 TUBP50607 506 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 BCAT1P54687 386 aa18.57■□□□□ 0.56
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PDE4D-204ENST00000358923 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA1257Q9ULG3 409 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 NEU2Q9Y3R4 380 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 PDHA1P08559 390 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 VIMP08670 466 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
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PDE4D-204ENST00000358923 ADCY1Q08828 1119 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 DSC3Q14574 896 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 ITIH4Q14624 930 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 FAXCQ5TGI0 409 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
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PDE4D-204ENST00000358923 GPR152Q8TDT2 470 aa18.57■□□□□ 0.56
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PDE4D-204ENST00000358923 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
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PDE4D-204ENST00000358923 E7ENQ6 273 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 PNPLA4P41247 253 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 CCNG1P51959 295 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 CCL23P55773 120 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
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PDE4D-204ENST00000358923 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 SCAMP5Q8TAC9 235 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.57■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa18.56■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 HOXD10P28358 340 aa18.56■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 TKTL1P51854 596 aa18.56■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 PTK7Q13308 1070 aa18.56■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 KRT81Q14533 505 aa18.56■□□□□ 0.56
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGAP17Q68EM7 881 aa18.56■□□□□ 0.56
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