RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274721.7

GFRA3-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3-201ENST00000274721 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 XRCC4Q13426 336 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 NTAN1Q96AB6 310 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 TRAPPC3O43617 180 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 TCEA3O75764 348 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 NCAM1P13591 858 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 GOT1P17174 413 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 NRLP54845 237 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 NME3Q13232 169 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 MFSD5Q6N075 450 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 SEPT8Q92599 483 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 CASD1Q96PB1 797 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.16■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 RASGRF2O14827 1237 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 ALOX15BO15296 676 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 ADRA1BP35368 520 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 ARL4AP40617 200 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 GBE1Q04446 702 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 SCAPQ12770 1279 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 TCTN1Q2MV58 587 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 APBB2Q92870 758 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 C9orf72Q96LT7 481 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 AMPD1P23109 780 aa22.14■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 RBL1P28749 1068 aa22.14■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 BEND5Q7L4P6 421 aa22.14■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.14■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.14■■□□□ 1.14
GFRA3-201ENST00000274721 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TLDC2A0PJX2 215 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TNFRSF10BO14763 440 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SYN3O14994 580 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ABHD2P08910 425 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ATP1A2P50993 1020 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 RNF208Q9H0X6 261 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 DTLQ9NZJ0 730 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 COX16Q9P0S2 106 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.14■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 I6L893 689 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TADA2AO75478 443 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 F9P00740 461 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 IRAK1P51617 712 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ABI1Q8IZP0 508 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ADAM32Q8TC27 787 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 RNF139Q8WU17 664 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SERPINB12Q96P63 405 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 PAK5Q9P286 719 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 KCNN4O15554 427 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MAP3K6O95382 1288 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 AGTP01019 485 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CCL5P13501 91 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 GAD2Q05329 585 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SEMA3BQ13214 749 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 EFHC2Q5JST6 749 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CENPUQ71F23 418 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 EDEM1Q92611 657 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TTC25Q96NG3 672 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 OLFM3Q96PB7 478 aa22.13■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 PATJQ8NI35 1801 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 E7ESA3 106 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TMEM63AO94886 807 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CXCL10P02778 98 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 OR4Q2P0C623 313 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CBLBQ13191 982 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 HIF1AQ16665 826 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.12■■□□□ 1.13
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