RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	BANP	Q8N9N5	519 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	WWP1	Q9H0M0	922 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	KRT34	O76011	436 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBED1	O96006	694 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CCR3	P51677	355 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	BST1	Q10588	318 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF398	Q8TD17	642 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PXMP2	Q9NR77	195 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXL18	Q96ME1	805 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PLSCR1	O15162	318 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SPTLC1	O15269	473 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	LYPLA2	O95372	231 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TNFSF9	P41273	254 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TAF5	Q15542	800 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TIMM22	Q9Y584	194 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	FBP2	O00757	339 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ACTR2	P61160	394 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RSPH3	Q86UC2	560 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	AGR3	Q8TD06	166 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CASP10	Q92851	521 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	MATN2	O00339	956 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CBFA2T3	O75081	653 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ARPC4	P59998	168 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ASPH	Q12797	758 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	HIC1	Q14526	733 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	INA	Q16352	499 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ADCY3	O60266	1144 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ANPEP	P15144	967 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	KDELR1	P24390	212 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC18A1	P54219	525 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CDH8	P55286	799 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PFKP	Q01813	784 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	STX3	Q13277	289 aa		11.75	□□□□□ -0.53

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