RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 TBC1D4O60343 1298 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 IL4RP24394 825 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 RDXP35241 583 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 SEC14L1Q92503 715 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 PNPLA8Q9NP80 782 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 IL23AQ9NPF7 189 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MDM4O15151 490 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 L1CAMP32004 1257 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 CUL1Q13616 776 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ANKS3Q6ZW76 656 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 BNIPLQ7Z465 357 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ACTL9Q8TC94 416 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 BADQ92934 168 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 FAM204AQ9H8W3 233 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ANLNQ9NQW6 1124 aa23■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 H7C4K7 107 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 EFEMP2O95967 443 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 USP46P62068 366 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 HDXQ7Z353 690 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ATL2Q8NHH9 583 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 IRGQQ8WZA9 623 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 RNF157Q96PX1 679 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 DDIT4Q9NX09 232 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 FZD10Q9ULW2 581 aa22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 PDK2Q15119 407 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 PSMD5Q16401 504 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 TAC4Q86UU9 113 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ZNF558Q96NG5 402 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 NMUR1Q9HB89 426 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MAP3K6O95382 1288 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ETS1P14921 441 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 GPR17Q13304 367 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 USP41Q3LFD5 358 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ZNF365Q70YC5 407 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 SCD5Q86SK9 330 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 PQLC3Q8N755 202 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 SLCO2A1Q92959 643 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 YME1L1Q96TA2 773 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.98■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 A0A1W2PQH9 124 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 TRIM66O15016 1216 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 DUSP4Q13115 394 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MTMR3Q13615 1198 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 DPYSL2Q16555 572 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 VSTM1Q6UX27 236 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 C8orf48Q96LL4 319 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 WDR27A2RRH5 827 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 I6L893 689 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MAP2K7O14733 419 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 PLTPP55058 493 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 PTK6Q13882 451 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 EMBQ6PCB8 327 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 NUP93Q8N1F7 819 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.96■■□□□ 1.27
VSX1-205ENST00000429762 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms