RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLD5Q8N7P1 536 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 P3H4Q92791 437 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS18Q9P253 973 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FZD10Q9ULW2 581 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SGK1O00141 431 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUDT17P0C025 328 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS41P49754 854 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AIF1P55008 147 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 P3H1Q32P28 736 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM60Q495X7 471 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BEND5Q7L4P6 421 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF333Q96JL9 665 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AAASQ9NRG9 546 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 M0QYT0 321 aa22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAPN9O14815 690 aa22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBP3P10745 1247 aa22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCL23P55773 120 aa22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM131BQ86XD5 332 aa22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH2P05091 517 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP2F1P24903 491 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GATMP50440 423 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCAR1P56945 870 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DEUP1Q05D60 604 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NTAN1Q96AB6 310 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MARCH5Q9NX47 278 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBX21Q9UL17 535 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC11A1P49279 550 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DMTNQ08495 405 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF844Q08AG5 666 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIGVQ9NUD9 493 aa22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNFRSF10BO14763 440 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCAM1P13591 858 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGFR3P22607 806 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP2C18P33260 490 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ROR1Q01973 937 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCAPQ12770 1279 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPS1Q13098 491 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MORF4L2Q15014 288 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPNTQ6UXI9 565 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RELL1Q8IUW5 271 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR6C75A6NL08 312 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F9P00740 461 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ETS1P14921 441 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GDF10P55107 478 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTMPQ5BVD1 217 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DENND2CQ68D51 928 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC43Q8N309 656 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARL8AQ96BM9 186 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLXNA3P51805 1871 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LTBP2Q14767 1821 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFNB1P01574 187 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR4Q2P0C623 313 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHKAP35790 457 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARL4AP40617 200 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR2C2P49116 596 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms