RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC6A11P48066 632 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 GAD2Q05329 585 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 PDE4CQ08493 712 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 BST2Q10589 180 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 RAB41Q5JT25 222 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR23BQ6ZRT6 265 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 HTR3DQ70Z44 454 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 TADA2BQ86TJ2 420 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 C12orf40Q86WS4 652 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 EHBP1Q8NDI1 1231 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC26Q8TAB7 109 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 KAT5Q92993 513 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 ACDQ96AP0 544 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 CLIC5Q9NZA1 410 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1257Q9ULG3 409 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP54Q96N23 3096 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 K7EQS6 105 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 TULP2O00295 520 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 HRO43593 1189 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 PAEPP09466 180 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 CNR2P34972 360 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 PLA2G4AP47712 749 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 PXNP49023 591 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 TKTL1P51854 596 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 SEC13P55735 322 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 LPAL2Q16609 132 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 BTBD8Q5XKL5 378 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 RRAGAQ7L523 313 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR5BQ86VZ2 330 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 CREBRFQ8IUR6 639 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA2013Q8IYS2 634 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF276Q8N554 614 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 UBA3Q8TBC4 463 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 PNKPQ96T60 521 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 SPHK2Q9NRA0 654 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-211ENST00000493436 O00370 1275 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 GREM1O60565 184 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 KAT7O95251 611 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 APODP05090 189 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 KDSRQ06136 332 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 DMC1Q14565 340 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 ANO4Q32M45 955 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 C2orf27AQ580R0 203 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 SYT13Q7L8C5 426 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM25Q86YD3 366 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 MIB1Q86YT6 1006 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 CAMKK1Q8N5S9 505 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 NAT16Q8N8M0 369 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 USP33Q8TEY7 942 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 TFAP2BQ92481 460 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 HHIPQ96QV1 700 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 MED15Q96RN5 788 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 ULBP1Q9BZM6 244 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC4Q9HBW1 653 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 GMEB2Q9UKD1 530 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 ANTXRLA6NF34 631 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 ZBED1O96006 694 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 SETSIPP0DME0 302 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 GCNT1Q02742 428 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 MESP2Q0VG99 397 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 EFEMP1Q12805 493 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 LCLAT1Q6UWP7 414 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP68Q76N32 757 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 SFTPA1Q8IWL2 248 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 MLKLQ8NB16 471 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF4Q9NR80 690 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 RASAL2Q9UJF2 1139 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 STC2O76061 302 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 BRD2P25440 801 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 GRIA2P42262 883 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 COG7P83436 770 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 ADIGQ0VDE8 80 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 CNGA2Q16280 664 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 PKDCCQ504Y2 493 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 LAIR1Q6GTX8 287 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 TPGS1Q6ZTW0 290 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-211ENST00000493436 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.2 ms