RNA–Protein interactions for RNA: YNL207W

RIO2, Essential serine kinase involved in the processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene RIO2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO2	YNL207W	YGR025W	P53216	100 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	PMP3	P87284	55 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	COX9	P07255	59 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	QCR9	P22289	66 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	YOR314W	Q12506	109 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.22	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
RIO2	YNL207W	PAU7	P39545	55 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	SWM2	P40342	146 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	OLI1	P61829	76 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.21	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	PAI3	P01094	68 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	SSS1	P35179	80 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YBR016W	P38216	128 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	SPI1	P40092	148 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	ATP17	Q06405	101 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	HUB1	Q6Q546	73 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		0.2	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		0.19	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YCR108C	Q3E819	63 aa		0.18	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YBL044W	P38194	122 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YSY6	P38374	65 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	DDR2	P89113	61 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		0.17	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	COA2	Q3E823	68 aa		0.16	□□□□□ -2.38
RIO2	YNL207W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		0.15	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	TOS6	P48560	102 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		0.14	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		0.13	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		0.12	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		0.11	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		0.1	□□□□□ -2.39
RIO2	YNL207W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		0.08	□□□□□ -2.4
RIO2	YNL207W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		0.07	□□□□□ -2.4
RIO2	YNL207W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		0.06	□□□□□ -2.4

Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 67.4 ms