RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	OST5	Q92316	86 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YPR153W	Q06537	140 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YDR010C	Q12426	110 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YGL034C	P53186	121 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AMD1	YML035C	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AMD1	YML035C	YDL012C	Q12489	107 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AMD1	YML035C	YHR125W	P38831	101 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AMD1	YML035C	SDH6	Q3E785	79 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AMD1	YML035C	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AMD1	YML035C	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		3.46	□□□□□ -1.85
AMD1	YML035C	HUB1	Q6Q546	73 aa		3.46	□□□□□ -1.86
AMD1	YML035C	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AMD1	YML035C	YJR128W	P47162	119 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AMD1	YML035C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AMD1	YML035C	COX7	P10174	60 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AMD1	YML035C	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AMD1	YML035C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AMD1	YML035C	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AMD1	YML035C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AMD1	YML035C	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AMD1	YML035C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AMD1	YML035C	YJL144W	P47009	104 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AMD1	YML035C	ATP17	Q06405	101 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AMD1	YML035C	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AMD1	YML035C	COX8	P04039	78 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AMD1	YML035C	YLR255C	O13574	117 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AMD1	YML035C	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AMD1	YML035C	MRX7	P53869	86 aa		3.27	□□□□□ -1.89
AMD1	YML035C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
AMD1	YML035C	OLI1	P61829	76 aa		3.24	□□□□□ -1.89
AMD1	YML035C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.24	□□□□□ -1.89
AMD1	YML035C	QCR10	P37299	77 aa		3.23	□□□□□ -1.89
AMD1	YML035C	YBR016W	P38216	128 aa		3.22	□□□□□ -1.89
AMD1	YML035C	FYV12	Q08559	129 aa		3.22	□□□□□ -1.89
AMD1	YML035C	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AMD1	YML035C	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AMD1	YML035C	YEL014C	P39999	101 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AMD1	YML035C	SOM1	Q05676	74 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AMD1	YML035C	YCR108C	Q3E819	63 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AMD1	YML035C	YBL044W	P38194	122 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AMD1	YML035C	YJL009W	P47078	108 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AMD1	YML035C	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AMD1	YML035C	YDR210W	Q03482	75 aa		2.98	□□□□□ -1.93
AMD1	YML035C	YML054C-A	Q3E809	52 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AMD1	YML035C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AMD1	YML035C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.79	□□□□□ -1.96
AMD1	YML035C	HHY1	P39982	102 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AMD1	YML035C	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		2.74	□□□□□ -1.97
AMD1	YML035C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		2.73	□□□□□ -1.97
AMD1	YML035C	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		2.71	□□□□□ -1.98
AMD1	YML035C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AMD1	YML035C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AMD1	YML035C	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AMD1	YML035C	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		2.33	□□□□□ -2.04
AMD1	YML035C	YHR050W-A	Q05451	56 aa		2.19	□□□□□ -2.06
AMD1	YML035C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		2.15	□□□□□ -2.07
AMD1	YML035C	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		1.94	□□□□□ -2.1

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