RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	YDL012C	Q12489	107 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UBX7	YBR273C	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBX7	YBR273C	YOR268C	Q08734	132 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBX7	YBR273C	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UBX7	YBR273C	MMS2	P53152	137 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBX7	YBR273C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UBX7	YBR273C	LCL2	Q08045	131 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBX7	YBR273C	OST5	Q92316	86 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBX7	YBR273C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBX7	YBR273C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBX7	YBR273C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBX7	YBR273C	YGL149W	P53116	101 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UBX7	YBR273C	YDR010C	Q12426	110 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UBX7	YBR273C	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UBX7	YBR273C	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UBX7	YBR273C	YLR255C	O13574	117 aa		3.04	□□□□□ -1.92
UBX7	YBR273C	YJR128W	P47162	119 aa		3.04	□□□□□ -1.92
UBX7	YBR273C	COX8	P04039	78 aa		3.02	□□□□□ -1.93
UBX7	YBR273C	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		3.02	□□□□□ -1.93
UBX7	YBR273C	COX7	P10174	60 aa		3	□□□□□ -1.93
UBX7	YBR273C	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		3	□□□□□ -1.93
UBX7	YBR273C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		2.99	□□□□□ -1.93
UBX7	YBR273C	ATP17	Q06405	101 aa		2.98	□□□□□ -1.93
UBX7	YBR273C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
UBX7	YBR273C	MRX7	P53869	86 aa		2.96	□□□□□ -1.93
UBX7	YBR273C	OLI1	P61829	76 aa		2.96	□□□□□ -1.93
UBX7	YBR273C	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
UBX7	YBR273C	YBR016W	P38216	128 aa		2.94	□□□□□ -1.94
UBX7	YBR273C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
UBX7	YBR273C	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		2.92	□□□□□ -1.94
UBX7	YBR273C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		2.89	□□□□□ -1.95
UBX7	YBR273C	YJL144W	P47009	104 aa		2.88	□□□□□ -1.95
UBX7	YBR273C	FYV12	Q08559	129 aa		2.87	□□□□□ -1.95
UBX7	YBR273C	YFL067W	P43537	175 aa		2.85	□□□□□ -1.95
UBX7	YBR273C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		2.82	□□□□□ -1.96
UBX7	YBR273C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
UBX7	YBR273C	QCR10	P37299	77 aa		2.78	□□□□□ -1.96
UBX7	YBR273C	YGL034C	P53186	121 aa		2.78	□□□□□ -1.96
UBX7	YBR273C	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		2.77	□□□□□ -1.97
UBX7	YBR273C	YEL014C	P39999	101 aa		2.77	□□□□□ -1.97
UBX7	YBR273C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.77	□□□□□ -1.97
UBX7	YBR273C	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		2.75	□□□□□ -1.97
UBX7	YBR273C	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		2.72	□□□□□ -1.97
UBX7	YBR273C	YBL044W	P38194	122 aa		2.71	□□□□□ -1.98
UBX7	YBR273C	YCR108C	Q3E819	63 aa		2.71	□□□□□ -1.98
UBX7	YBR273C	YML054C-A	Q3E809	52 aa		2.68	□□□□□ -1.98
UBX7	YBR273C	SOM1	Q05676	74 aa		2.66	□□□□□ -1.98
UBX7	YBR273C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
UBX7	YBR273C	YJL009W	P47078	108 aa		2.63	□□□□□ -1.99
UBX7	YBR273C	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		2.59	□□□□□ -2
UBX7	YBR273C	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		2.53	□□□□□ -2
UBX7	YBR273C	YDR210W	Q03482	75 aa		2.52	□□□□□ -2.01
UBX7	YBR273C	HHY1	P39982	102 aa		2.49	□□□□□ -2.01
UBX7	YBR273C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.17	□□□□□ -2.06
UBX7	YBR273C	YHR050W-A	Q05451	56 aa		2.1	□□□□□ -2.07
UBX7	YBR273C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	2.09	□□□□□ -2.08
UBX7	YBR273C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		1.99	□□□□□ -2.09
UBX7	YBR273C	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		1.97	□□□□□ -2.09
UBX7	YBR273C	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	1.96	□□□□□ -2.1
UBX7	YBR273C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		1.96	□□□□□ -2.1
UBX7	YBR273C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		1.95	□□□□□ -2.1
UBX7	YBR273C	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		1.76	□□□□□ -2.13
UBX7	YBR273C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		1.45	□□□□□ -2.18

Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 68 ms