RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532872.5

RPS3-218, Transcript of ribosomal protein S3, human

TSL 3

Gene RPS3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS3-218	ENST00000532872	EML5	Q05BV3	1969 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	TLR5	O60602	858 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	EPN2	O95208	641 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	ADH5	P11766	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	ADORA2B	P29275	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	GTF2H1	P32780	548 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	KRT39	Q6A163	491 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	PNKP	Q96T60	521 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	SLC30A4	O14863	429 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	CILP	O75339	1184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	KAT7	O95251	611 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	APOD	P05090	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	CD58	P19256	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	SLC6A11	P48066	632 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	DGKE	P52429	567 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	GAD2	Q05329	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	PLK5	Q496M5	336 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872		A0A0A0MRY4	1105 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	CETN3	O15182	167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	STX10	O60499	249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	GRIA2	P42262	883 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	PGF	P49763	221 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	MXI1	P50539	228 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	PNOC	Q13519	176 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	ELF2	Q15723	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	CRY1	Q16526	586 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-218	ENST00000532872	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	ANTXRL	A6NF34	631 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	CYP26A1	O43174	497 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	GDF9	O60383	454 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	RHOBTB1	O94844	696 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	IRF1	P10914	325 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	TIE1	P35590	1138 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	KDSR	Q06136	332 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	MESP2	Q0VG99	397 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	BECN1	Q14457	450 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	HTR3D	Q70Z44	454 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-218	ENST00000532872	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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