RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TSC2	P49815	1807 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ENC1	O14682	589 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TEX28	O15482	410 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	DAB1	O75553	588 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF8	O76064	485 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	FYN	P06241	537 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	FOSL2	P15408	326 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	DES	P17661	470 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SDC4	P31431	198 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CTNNB1	P35222	781 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PSEN1	P49768	467 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC5A3	P53794	718 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBB4B	P68371	445 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ITIH3	Q06033	890 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TAF5	Q15542	800 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CREG2	Q8IUH2	290 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	BTBD6	Q96KE9	485 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	NPY6R	Q99463	290 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	GBF1	Q92538	1859 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529		E7ENQ6	273 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SPOP	O43791	374 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	GJB6	O95452	261 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	F9	P00740	461 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	LTF	P02788	710 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT7	P08729	469 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	MYOG	P15173	224 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMA2	P25787	234 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ARPP19	P56211	112 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	RWDD2B	P57060	319 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVFC1	P60507	584 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CAMK1	Q14012	370 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	DDR2	Q16832	855 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	EMC1	Q8N766	993 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TBCB	Q99426	244 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	C2CD2L	O14523	706 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	LRCH4	O75427	683 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	PAPLN	O95428	1278 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	SEC24A	O95486	1093 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	ADH1A	P07327	375 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	CA3	P07451	260 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	YWHAQ	P27348	245 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP3CC	P48454	512 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	COPS2	P61201	443 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	PLD1	Q13393	1074 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	EXD1	Q8NHP7	514 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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