RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 POLE2P56282 527 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ARL4CP56559 192 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 BLOC1S1P78537 153 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ACOX1Q15067 660 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 PTPRRQ15256 657 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TBCCQ15814 346 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TXNRD1Q16881 649 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TIGD6Q17RP2 521 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TREML2Q5T2D2 321 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 RFX8Q6ZV50 586 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 RSC1A1Q92681 617 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 R3HDM4Q96D70 268 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 PBKQ96KB5 322 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 Q96MF0 132 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 RTKNQ9BST9 563 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 WDR11Q9BZH6 1224 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 PRDM8Q9NQV8 689 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 KLC4Q9NSK0 619 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 EHD3Q9NZN3 535 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 DKK3Q9UBP4 350 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 EXOC5O00471 708 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 MPPED1O15442 326 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 IRAK2O43187 625 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 PEX1O43933 1283 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TAF5LO75529 589 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 WDR47O94967 919 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 NXPH3O95157 252 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ONECUT2O95948 504 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 CHRM2P08172 466 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 CD19P15391 556 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 KLRK1P26718 216 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 PCSK6P29122 969 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 AP2B1P63010 937 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 MTAPQ13126 283 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 GRM4Q14833 912 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TAF5Q15542 800 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 NBPF8Q3BBV2 869 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM60Q495X7 471 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 SPRED1Q7Z699 444 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 RFKQ969G6 155 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FBXL20Q96IG2 436 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 GPR20Q99678 358 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 GABRQQ9UN88 632 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A18PA6NE21 464 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A16PA6NEW6 464 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 A8MVJ9 347 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA0355O15063 1070 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FAM155BO75949 473 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A15PP0C7V4 464 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FAM90A14PP0C7W9 464 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TGM1P22735 817 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 YY1P25490 414 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 AKT1P31749 480 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 FOLR3P41439 243 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 BMPR2Q13873 1038 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 CSHL1Q14406 222 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 PTPAQ15257 358 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 CYP1B1Q16678 543 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ST3GAL2Q16842 350 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 BTBD16Q32M84 506 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms